Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77199 Date Thu Jan 5 12:26:15 GMT 2012 Unique Job ID cc96b6951013575a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	S	W	K	K	K	L	V	V	S	Q	L	A	L	A	C	T	L	A	I	T	S	Q	A	N	A	A	N	Y	D	T	W	T	Y	I	D	N	P	V	T	A	L	D	W	D	H	M	D	K	A	G	T	V	D	G	N	Y	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?					?				?							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	S	G	F	V	Y	Y	N	N	T	N	G	D	F	D	Q	S	F	N	G	D	T	V	N	G	T	I	S	T	Y	Y	L	N	H	D	Y	A	D	S	T	A	N	Q	L	D	I	S	N	S	V	I	H	G	S	I	T	S	M	L	P
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SS confidence
Disorder																							?	?												?			?	?	?	?	?	?			?		?		?								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	G	Y	Y	D	R	F	D	A	D	G	N	N	L	G	G	Y	D	F	Y	T	D	A	V	V	D	T	H	W	R	D	G	D	V	F	T	L	N	I	A	N	T	T	I	D	D	D	Y	E	A	L	Y	F	T	D	S	Y	K	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																						?	?	?	?	?	?						?				?																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	V	T	K	H	T	N	E	T	F	D	T	S	E	G	V	A	V	N	L	D	V	E	S	N	I	N	I	S	N	N	S	R	V	A	G	I	A	L	S	Q	G	N	T	Y	N	E	T	Y	T	T	E	S	H	T	W	D	N	N	I
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Disorder		?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?						?	?	?	?			?	?		?															?	?								?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	V	K	D	S	T	V	T	S	G	S	N	Y	I	L	D	S	N	T	Y	G	K	T	G	H	F	G	N	S	D	E	P	S	D	Y	A	G	P	G	D	V	A	M	S	F	T	A	S	G	S	D	Y	A	M	K	N	N	V	F	L
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SS confidence
Disorder				?	?										?	?	?	?	?		?						?	?		?		?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	N	S	T	L	M	G	D	V	A	F	T	S	T	W	N	S	N	F	D	P	N	G	H	D	S	N	G	D	G	V	K	D	T	N	G	G	W	T	D	D	S	L	N	V	D	E	L	N	L	T	L	D	N	G	S	K	W	V	G
Secondary structure
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Disorder		?		?	?												?													?		?	?	?	?	?				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	A	I	Y	N	V	A	E	T	S	A	M	Y	D	V	A	T	N	S	L	T	P	D	A	T	Y	E	N	N	D	W	K	R	V	V	D	D	K	V	F	Q	S	G	V	F	N	V	A	L	N	N	G	S	E	W	D	T	T	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?			?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?					?					?			?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		S	I	V	D	T	L	T	V	N	N	G	S	Q	V	N	V	S	E	S	K	L	T	S	D	T	I	D	L	T	N	G	S	S	L	N	I	G	E	D	G	Y	V	D	T	D	H	L	T	I	N	S	Y	S	T	V	A	L	T	E	S
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?							?	?				?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	G	W	G	A	D	Y	N	L	Y	A	N	T	I	T	V	T	N	G	G	V	L	D	V	N	V	D	Q	F	D	T	E	A	F	R	T	D	K	L	E	L	T	S	G	N	I	A	D	H	N	G	N	V	V	S	G	V	F	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		H	S	S	D	Y	V	L	N	A	D	L	V	N	D	R	T	W	D	T	S	K	S	N	Y	G	Y	G	I	V	A	M	N	S	D	G	H	L	T	I	N	G	N	G	D	V	D	N	G	T	E	L	D	N	S	S	V	D	N	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	A	T	G	N	Y	K	V	R	I	D	N	A	T	G	A	G	A	I	A	D	Y	K	D	K	E	I	I	Y	V	N	D	V	N	S	N	A	T	F	S	A	A	N	K	A	D	L	G	A	Y	T	Y	Q	A	E	Q	R	G	N	T
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Disorder												?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?			?					?																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	V	L	Q	Q	M	E	L	T	D	Y	A	N	M	A	L	S	I	P	S	A	N	T	N	I	W	N	L	E	Q	D	T	V	G	T	R	L	T	N	S	R	H	G	L	A	D	N	G	G	A	W	V	S	Y	F	G	G	N	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		G	D	N	G	T	I	N	Y	D	Q	D	V	N	G	I	M	V	G	V	D	T	K	I	D	G	N	N	A	K	W	I	V	G	A	A	A	G	F	A	K	G	D	M	N	D	R	S	G	Q	V	D	Q	D	S	Q	T	A	Y	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		S	S	A	H	F	A	N	N	V	F	V	D	G	S	L	S	Y	S	H	F	N	N	D	L	S	A	T	M	S	N	G	T	Y	V	D	G	S	T	N	S	D	A	W	G	F	G	L	K	A	G	Y	D	F	K	L	G	D	A	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?					?	?	?	?	?	?	?		?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		V	T	P	Y	G	S	V	S	G	L	F	Q	S	G	D	D	Y	Q	L	S	N	D	M	K	V	D	G	Q	S	Y	D	S	M	R	Y	E	L	G	V	D	A	G	Y	T	F	T	Y	S	E	D	Q	A	L	T	P	Y	F	K	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?		?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		Y	V	Y	D	D	S	N	N	D	N	D	V	N	G	D	S	I	D	N	G	T	E	G	S	A	V	R	V	G	L	G	T	Q	F	S	F	T	K	N	F	S	A	Y	T	D	A	N	Y	L	G	G	G	D	V	D	Q	D	W	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?			?																												?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	V	G	V	K	Y	T	W
Secondary structure
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Disorder									?
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