Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A6Z3 Date Thu Jan 5 11:04:17 GMT 2012 Unique Job ID cc39b1aa0dc0c1e4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	G	Q	E	T	R	G	F	Q	S	E	V	K	Q	L	L	H	L	M	I	H	S	L	Y	S	N	K	E	I	F	L	R	E	L	I	S	N	A	S	D	A	A	D	K	L	R	F	R	A	L	S	N	P	D	L	Y	E	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?																																									?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	E	L	R	V	R	V	S	F	D	K	D	K	R	T	L	T	I	S	D	N	G	V	G	M	T	R	D	E	V	I	D	H	L	G	T	I	A	K	S	G	T	K	S	F	L	E	S	L	G	S	D	Q	A	K	D	S	Q	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	Q	F	G	V	G	F	Y	S	A	F	I	V	A	D	K	V	T	V	R	T	R	A	A	G	E	K	P	E	N	G	V	F	W	E	S	A	G	E	G	E	Y	T	V	A	D	I	T	K	E	D	R	G	T	E	I	T	L	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	E	G	E	D	E	F	L	D	D	W	R	V	R	S	I	I	S	K	Y	S	D	H	I	A	L	P	V	E	I	E	K	R	E	E	K	D	G	E	T	V	I	S	W	E	K	I	N	K	A	Q	A	L	W	T	R	N	K	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	T	D	E	E	Y	K	E	F	Y	K	H	I	A	H	D	F	N	D	P	L	T	W	S	H	N	R	V	E	G	K	Q	E	Y	T	S	L	L	Y	I	P	S	Q	A	P	W	D	M	W	N	R	D	H	K	H	G	L	K	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	Q	R	V	F	I	M	D	D	A	E	Q	F	M	P	N	Y	L	R	F	V	R	G	L	I	D	S	S	D	L	P	L	N	V	S	R	E	I	L	Q	D	S	T	V	T	R	N	L	R	N	A	L	T	K	R	V	L	Q	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	K	L	A	K	D	D	A	E	K	Y	Q	T	F	W	Q	Q	F	G	L	V	L	K	E	G	P	A	E	D	F	A	N	Q	E	A	I	A	K	L	L	R	F	A	S	T	H	T	D	S	S	A	Q	T	V	S	L	E	D	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?																																							?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	R	M	K	E	G	Q	E	K	I	Y	Y	I	T	A	D	S	Y	A	A	A	K	S	S	P	H	L	E	L	L	R	K	K	G	I	E	V	L	L	L	S	D	R	I	D	E	W	M	M	N	Y	L	T	E	F	D	G	K	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	S	V	S	K	V	D	E	S	L	E	K	L	A	D	E	V	D	E	S	A	K	E	A	E	K	A	L	T	P	F	I	D	R	V	K	A	L	L	G	E	R	V	K	D	V	R	L	T	H	R	L	T	D	T	P	A	I	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	D	A	D	E	M	S	T	Q	M	A	K	L	F	A	A	A	G	Q	K	V	P	E	V	K	Y	I	F	E	L	N	P	D	H	V	L	V	K	R	A	A	D	T	E	D	E	A	K	F	S	E	W	V	E	L	L	L	D	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
Sequence		L	L	A	E	R	G	T	L	E	D	P	N	L	F	I	R	R	M	N	Q	L	L	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?														?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand