Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46821 Date Thu Jan 5 12:34:46 GMT 2012 Unique Job ID cabcf12bf581046a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	A	I	D	S	Q	L	P	S	S	S	G	Q	D	R	P	T	D	E	V	D	R	I	L	S	P	G	K	L	I	I	L	G	L	Q	H	V	L	V	M	Y	A	G	A	V	A	V	P	L	M	I	G	D	R	L	G	L	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	A	I	A	M	L	I	S	S	D	L	F	C	C	G	I	V	T	L	L	Q	C	I	G	I	G	R	F	M	G	I	R	L	P	V	I	M	S	V	T	F	A	A	V	T	P	M	I	A	I	G	M	N	P	D	I	G	L	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?										?																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	F	G	A	T	I	A	A	G	F	I	T	T	L	L	A	P	L	I	G	R	L	M	P	L	F	P	P	L	V	T	G	V	V	I	T	S	I	G	L	S	I	I	Q	V	G	I	D	W	A	A	G	G	K	G	N	P	Q	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	P	V	Y	L	G	I	S	F	A	V	L	I	F	I	L	L	I	T	R	Y	A	K	G	F	M	S	N	V	A	V	L	L	G	I	V	F	G	F	L	L	S	W	M	M	N	E	V	N	L	S	G	L	H	D	A	S	W	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?		?	?	?			?	?																					?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	V	T	P	M	S	F	G	M	P	I	F	D	P	V	S	I	L	T	M	T	A	V	L	I	I	V	F	I	E	S	M	G	M	F	L	A	L	G	E	I	V	G	R	K	L	S	S	H	D	I	I	R	G	L	R	V	D	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	T	M	I	G	G	T	F	N	S	F	P	H	T	S	F	S	Q	N	V	G	L	V	S	V	T	R	V	H	S	R	W	V	C	I	S	S	G	I	I	L	I	L	F	G	M	V	P	K	M	A	V	L	V	A	S	I	P	Q	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?		?		?	?	?	?	?	?						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	L	G	G	A	G	L	V	M	F	G	M	V	L	A	T	G	I	R	I	L	S	R	C	N	Y	T	T	N	R	Y	N	L	Y	I	V	A	I	S	L	G	V	G	M	T	P	T	L	S	H	D	F	F	S	K	L	P	A	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	P	L	L	H	S	G	I	M	L	A	T	L	S	A	V	V	L	N	V	F	F	N	G	Y	Q	H	H	A	D	L	V	K	E	S	V	S	D	K	D	L	K	V	R	T	V	R	M	W	L	L	M	R	K	L	K	K	N	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.
Sequence		G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand