Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37683 Date Thu Jan 5 11:56:58 GMT 2012 Unique Job ID ca7572bfffb536e0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	L	L	I	I	L	T	Y	V	A	F	A	W	A	M	F	K	I	F	K	I	P	V	N	K	W	T	I	P	T	A	A	L	G	G	I	F	I	V	S	G	L	I	L	L	M	N	Y	N	H	P	Y	T	F	K	A	Q	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	I	S	I	P	V	V	P	Q	V	T	G	V	V	I	E	V	T	D	K	K	N	T	L	I	K	K	G	E	V	L	F	R	L	D	P	T	R	Y	Q	A	R	V	D	R	L	M	A	D	I	V	T	A	E	H	K	Q	R	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	A	E	L	D	E	M	A	A	N	T	Q	Q	A	K	A	T	R	D	K	F	A	K	E	Y	Q	R	Y	A	R	G	S	Q	A	K	V	N	P	F	S	E	R	D	I	D	V	A	R	Q	N	Y	L	A	Q	E	A	S	V	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	A	A	E	Q	K	Q	I	Q	S	Q	L	D	S	L	V	L	G	E	H	S	Q	I	A	S	L	K	A	Q	L	A	E	A	K	Y	N	L	E	Q	T	I	V	R	A	P	S	D	G	Y	V	T	Q	V	L	I	R	P	G	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?			?				?	?																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	A	S	L	P	L	R	P	V	M	V	F	I	P	D	Q	K	R	Q	I	V	A	Q	F	R	Q	N	S	L	L	R	L	A	P	G	D	D	A	E	V	V	F	N	A	L	P	G	K	V	F	S	G	K	L	A	A	I	S	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																														?	?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	P	G	G	A	Y	Q	S	T	G	T	L	Q	T	L	N	T	A	P	G	S	D	G	V	I	A	T	I	E	L	D	E	H	T	D	L	S	A	L	P	D	G	I	Y	A	Q	V	A	V	Y	S	D	H	F	S	H	V	S	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?														?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	K	V	L	L	R	M	T	S	W	V	H	Y	L	Y	L	D	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand