Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39452 Date Thu Jan 5 12:00:51 GMT 2012 Unique Job ID ca69fe18963e570d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	T	T	T	A	E	C	L	T	Q	E	T	M	D	Y	H	A	L	N	A	M	L	N	L	Y	D	S	A	G	R	I	Q	F	D	K	D	R	Q	A	V	D	A	F	I	A	T	H	V	R	P	N	S	V	T	F	S	S	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																																				?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	R	L	N	W	L	V	N	E	G	Y	Y	D	E	S	V	L	N	R	Y	S	R	D	F	V	I	T	L	F	T	H	A	H	T	S	G	F	R	F	Q	T	F	L	G	A	W	K	F	Y	T	S	Y	T	L	K	T	F	D	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	Y	L	E	D	F	A	D	R	V	T	M	V	A	L	T	L	A	Q	G	D	E	T	L	A	L	Q	L	T	D	E	M	L	S	G	R	F	Q	P	A	T	P	T	F	L	N	C	G	K	Q	Q	R	G	E	L	V	S	C	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	R	I	E	D	N	M	E	S	I	G	R	A	V	N	S	A	L	Q	L	S	K	R	G	G	G	V	A	F	L	L	S	N	L	R	E	A	G	A	P	I	K	R	I	E	N	Q	S	S	G	V	I	P	V	M	K	M	L	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	F	S	Y	A	N	Q	L	G	A	R	Q	G	A	G	A	V	Y	L	H	A	H	H	P	D	I	L	R	F	L	D	T	K	R	E	N	A	D	E	K	I	R	I	K	T	L	S	L	G	V	V	I	P	D	I	T	F	H	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	E	N	A	Q	M	A	L	F	S	P	Y	D	V	E	R	V	Y	G	K	P	F	A	D	V	A	I	S	Q	H	Y	D	E	L	V	A	D	E	R	I	R	K	K	Y	L	N	A	R	D	F	F	Q	R	L	A	E	I	Q	F	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	G	Y	P	Y	I	M	Y	E	D	T	V	N	R	A	N	P	I	A	G	R	I	N	M	S	N	L	C	S	E	I	L	Q	V	N	S	A	S	E	Y	D	E	N	L	D	Y	T	R	T	G	H	D	I	S	C	N	L	G	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?															?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		N	I	A	H	T	M	D	S	P	D	F	A	R	T	V	E	T	A	V	R	G	L	T	A	V	S	D	M	S	H	I	R	S	V	P	S	I	E	A	G	N	A	A	S	H	A	I	G	L	G	Q	M	N	L	H	G	Y	L	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	G	I	A	Y	G	S	P	E	A	L	D	F	T	N	L	Y	F	Y	A	I	T	W	H	A	L	R	T	S	M	L	L	A	R	E	R	G	E	T	F	A	G	F	K	Q	S	R	Y	A	S	G	E	Y	F	S	Q	Y	L	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?						?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		N	W	Q	P	K	T	A	K	V	G	E	L	F	T	R	S	G	I	T	L	P	T	R	E	M	W	A	Q	L	R	D	D	V	M	R	Y	G	I	Y	N	Q	N	L	Q	A	V	P	P	T	G	S	I	S	Y	I	N	H	A	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?											?	?			?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		S	I	H	P	I	V	A	K	V	E	I	R	K	E	G	K	T	G	R	V	Y	Y	P	A	P	F	M	T	N	E	N	L	A	L	Y	Q	D	A	Y	E	I	G	A	E	K	I	I	D	T	Y	A	E	A	T	R	H	V	D	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
Sequence		L	S	L	T	L	F	F	P	D	T	A	T	T	R	D	I	N	K	A	Q	I	Y	A	W	R	K	G	I	K	T	L	Y	Y	I	R	L	R	Q	M	A	L	E	G	T	E	I	E	G	C	V	S	C	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand