Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P05055 Date Thu Jan 5 10:58:40 GMT 2012 Unique Job ID ca1ca738bc4b240a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	N	P	I	V	R	K	F	Q	Y	G	Q	H	T	V	T	L	E	T	G	M	M	A	R	Q	A	T	A	A	V	M	V	S	M	D	D	T	A	V	F	V	T	V	V	G	Q	K	K	A	K	P	G	Q	D	F	F	P	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?									?																																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	N	Y	Q	E	R	T	Y	A	A	G	R	I	P	G	S	F	F	R	R	E	G	R	P	S	E	G	E	T	L	I	A	R	L	I	D	R	P	I	R	P	L	F	P	E	G	F	V	N	E	V	Q	V	I	A	T	V	V	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	P	Q	V	N	P	D	I	V	A	M	I	G	A	S	A	A	L	S	L	S	G	I	P	F	N	G	P	I	G	A	A	R	V	G	Y	I	N	D	Q	Y	V	L	N	P	T	Q	D	E	L	K	E	S	K	L	D	L	V	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	T	E	A	A	V	L	M	V	E	S	E	A	Q	L	L	S	E	D	Q	M	L	G	A	V	V	F	G	H	E	Q	Q	Q	V	V	I	Q	N	I	N	E	L	V	K	E	A	G	K	P	R	W	D	W	Q	P	E	P	V	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	L	N	A	R	V	A	A	L	A	E	A	R	L	S	D	A	Y	R	I	T	D	K	Q	E	R	Y	A	Q	V	D	V	I	K	S	E	T	I	A	T	L	L	A	E	D	E	T	L	D	E	N	E	L	G	E	I	L	H	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	K	N	V	V	R	S	R	V	L	A	G	E	P	R	I	D	G	R	E	K	D	M	I	R	G	L	D	V	R	T	G	V	L	P	R	T	H	G	S	A	L	F	T	R	G	E	T	Q	A	L	V	T	A	T	L	G	T	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	A	Q	V	L	D	E	L	M	G	E	R	T	D	T	F	L	F	H	Y	N	F	P	P	Y	S	V	G	E	T	G	M	V	G	S	P	K	R	R	E	I	G	H	G	R	L	A	K	R	G	V	L	A	V	M	P	D	M	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	P	Y	T	V	R	V	V	S	E	I	T	E	S	N	G	S	S	S	M	A	S	V	C	G	A	S	L	A	L	M	D	A	G	V	P	I	K	A	A	V	A	G	I	A	M	G	L	V	K	E	G	D	N	Y	V	V	L	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	L	G	D	E	D	H	L	G	D	M	D	F	K	V	A	G	S	R	D	G	I	S	A	L	Q	M	D	I	K	I	E	G	I	T	K	E	I	M	Q	V	A	L	N	Q	A	K	G	A	R	L	H	I	L	G	V	M	E	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		I	N	A	P	R	G	D	I	S	E	F	A	P	R	I	H	T	I	K	I	N	P	D	K	I	K	D	V	I	G	K	G	G	S	V	I	R	A	L	T	E	E	T	G	T	T	I	E	I	E	D	D	G	T	V	K	I	A	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?						?			?		?					?						?																					?	?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		D	G	E	K	A	K	H	A	I	R	R	I	E	E	I	T	A	E	I	E	V	G	R	V	Y	T	G	K	V	T	R	I	V	D	F	G	A	F	V	A	I	G	G	G	K	E	G	L	V	H	I	S	Q	I	A	D	K	R	V	E
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.
Sequence		K	V	T	D	Y	L	Q	M	G	Q	E	V	P	V	K	V	L	E	V	D	R	Q	G	R	I	R	L	S	I	K	E	A	T	E	Q	S	Q	P	A	A	A	P	E	A	P	A	A	E	Q	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand