Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P36672 Date Thu Jan 5 11:53:37 GMT 2012 Unique Job ID c979efe6b9315f86

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	S	K	I	N	Q	T	D	I	D	R	L	I	E	L	V	G	G	R	G	N	I	A	T	V	S	H	C	I	T	R	L	R	F	V	L	N	Q	P	A	N	A	R	P	K	E	I	E	Q	L	P	M	V	K	G	C	F	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																						?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	G	Q	F	Q	V	V	I	G	T	N	V	G	D	Y	Y	Q	A	L	I	A	S	T	G	Q	A	Q	V	D	K	E	Q	V	K	K	A	A	R	H	N	M	K	W	H	E	Q	L	I	S	H	F	A	V	I	F	F	P	L	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	L	I	S	G	G	L	I	L	G	F	R	N	V	I	G	D	L	P	M	S	N	G	Q	T	L	A	Q	M	Y	P	S	L	Q	T	I	Y	D	F	L	W	L	I	G	E	A	I	F	F	Y	L	P	V	G	I	C	W	S	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?		?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	K	M	G	G	T	P	I	L	G	I	V	L	G	V	T	L	V	S	P	Q	L	M	N	A	Y	L	L	G	Q	Q	L	P	E	V	W	D	F	G	M	F	S	I	A	K	V	G	Y	Q	A	Q	V	I	P	A	L	L	A	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?			?	?										?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	L	G	V	I	E	T	R	L	K	R	I	V	P	D	Y	L	Y	L	V	V	V	P	V	C	S	L	I	L	A	V	F	L	A	H	A	L	I	G	P	F	G	R	M	I	G	D	G	V	A	F	A	V	R	H	L	M	T	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	A	P	I	G	A	A	L	F	G	F	L	Y	A	P	L	V	I	T	G	V	H	Q	T	T	L	A	I	D	L	Q	M	I	Q	S	M	G	G	T	P	V	W	P	L	I	A	L	S	N	I	A	Q	G	S	A	V	I	G	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	S	S	R	K	H	N	E	R	E	I	S	V	P	A	A	I	S	A	W	L	G	V	T	E	P	A	M	Y	G	I	N	L	K	Y	R	F	P	M	L	C	A	M	I	G	S	G	L	A	G	L	L	C	G	L	N	G	V	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?																																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Sequence		N	G	I	G	V	G	G	L	P	G	I	L	S	I	Q	P	S	Y	W	Q	V	F	A	L	A	M	A	I	A	I	I	I	P	I	V	L	T	S	F	I	Y	Q	R	K	Y	R	L	G	T	L	D	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?		?	?	?							?																														?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand