Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75919 Date Thu Jan 5 12:16:03 GMT 2012 Unique Job ID c8eb5f8ce3b5b1b6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	R	L	A	S	A	V	L	P	L	C	S	Q	H	P	G	Q	C	G	L	F	P	L	E	K	S	L	D	A	F	A	A	R	Y	R	L	A	E	M	A	E	H	T	L	D	V	Q	Y	Y	I	W	Q	D	D	M	S	G	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	F	S	A	L	L	A	A	A	K	R	G	V	R	V	R	L	L	L	D	D	N	N	T	P	G	L	D	D	I	L	R	L	L	D	S	H	P	R	I	E	V	R	L	F	N	P	F	S	F	R	L	L	R	P	L	G	Y	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	F	S	R	L	N	R	R	M	H	N	K	S	F	T	V	D	G	V	V	T	L	V	G	G	R	N	I	G	D	A	Y	F	G	A	G	E	E	P	L	F	S	D	L	D	V	M	A	I	G	P	V	V	E	D	V	A	D	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	R	Y	W	Y	C	K	S	V	S	P	L	Q	Q	V	L	D	V	P	E	G	E	M	A	D	R	I	E	L	P	A	S	W	H	N	D	A	M	T	H	R	Y	L	R	K	M	E	S	S	P	F	I	N	H	L	V	D	G	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	L	I	W	A	K	T	R	L	L	S	D	D	P	A	K	G	E	G	K	A	K	R	H	S	L	L	P	Q	R	L	F	D	I	M	G	S	P	S	E	R	I	D	I	I	S	S	Y	F	V	P	T	R	A	G	V	A	Q	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	M	V	R	K	G	V	K	I	A	I	L	T	N	S	L	A	A	N	D	V	A	V	V	H	A	G	Y	A	R	W	R	K	K	L	L	R	Y	G	V	E	L	Y	E	L	K	P	T	R	E	Q	S	S	T	L	H	D	R	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	G	N	S	G	A	S	L	H	A	K	T	F	S	I	D	G	K	T	V	F	I	G	S	F	N	F	D	P	R	S	T	L	L	N	T	E	M	G	F	V	I	E	S	E	T	L	A	Q	L	I	D	K	R	F	I	Q	S	Q	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Sequence		D	A	A	W	Q	L	R	L	D	R	W	G	R	I	N	W	V	D	R	H	A	K	K	E	I	I	L	K	K	E	P	A	T	S	F	W	K	R	V	M	V	R	L	A	S	I	L	P	V	E	W	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?																											?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand