Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77243 Date Thu Jan 5 12:26:44 GMT 2012 Unique Job ID c8b48861b9a1b681

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	A	Q	I	N	N	I	R	P	E	F	D	R	E	I	V	D	I	V	D	Y	V	M	N	Y	E	I	S	S	K	V	A	Y	D	T	A	H	Y	C	L	L	D	T	L	G	C	G	L	E	A	L	E	Y	P	A	C	K	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	G	P	I	V	P	G	T	V	V	P	N	G	V	R	V	P	G	T	Q	F	Q	L	D	P	V	Q	A	A	F	N	I	G	A	M	I	R	W	L	D	F	N	D	T	W	L	A	A	E	W	G	H	P	S	D	N	L	G	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?			?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	T	A	D	W	L	S	R	N	A	V	A	S	G	K	A	P	L	T	M	K	Q	V	L	T	A	M	I	K	A	H	E	I	Q	G	C	I	A	L	E	N	S	F	N	R	V	G	L	D	H	V	L	L	V	K	V	A	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	V	V	A	E	M	L	G	L	T	R	E	E	I	L	N	A	V	S	L	A	W	V	D	G	Q	S	L	R	T	Y	R	H	A	P	N	T	G	T	R	K	S	W	A	A	G	D	A	T	S	R	A	V	R	L	A	L	M	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	G	E	M	G	Y	P	S	A	L	T	A	P	V	W	G	F	Y	D	V	S	F	K	G	E	S	F	R	F	Q	R	P	Y	G	S	Y	V	M	E	N	V	L	F	K	I	S	F	P	A	E	F	H	S	Q	T	A	V	E	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	T	L	Y	E	Q	M	Q	A	A	G	K	T	A	A	D	I	E	K	V	T	I	R	T	H	E	A	C	I	R	I	I	D	K	K	G	P	L	N	N	P	A	D	R	D	H	C	I	Q	Y	M	V	A	I	P	L	L	F	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?		?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	T	A	A	D	Y	E	D	N	V	A	Q	D	K	R	I	D	A	L	R	E	K	I	N	C	F	E	D	P	A	F	T	A	D	Y	H	D	P	E	K	R	A	I	A	N	A	I	T	L	E	F	T	D	G	T	R	F	E	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	V	E	Y	P	I	G	H	A	R	R	R	Q	D	G	I	P	K	L	V	D	K	F	K	I	N	L	A	R	Q	F	P	T	R	Q	Q	Q	R	I	L	E	V	S	L	D	R	A	R	L	E	Q	M	P	V	N	E	Y	L	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?	?		?																																													?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		Y	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand