Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76298 Date Thu Jan 5 12:21:40 GMT 2012 Unique Job ID c6d306720198cc3f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	N	L	A	A	M	L	R	L	P	A	N	L	K	S	T	Q	W	Q	I	L	A	G	P	I	L	I	L	L	I	L	S	M	M	V	L	P	L	P	A	F	I	L	D	L	L	F	T	F	N	I	A	L	S	I	M	V	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	A	M	F	T	Q	R	T	L	E	F	A	A	F	P	T	I	L	L	F	T	T	L	L	R	L	A	L	N	V	A	S	T	R	I	I	L	M	E	G	H	T	G	A	A	A	A	G	K	V	V	E	A	F	G	H	F	L	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																																							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	N	F	A	I	G	I	V	V	F	V	I	L	V	I	I	N	F	M	V	I	T	K	G	A	G	R	I	A	E	V	G	A	R	F	V	L	D	G	M	P	G	K	Q	M	A	I	D	A	D	L	N	A	G	L	I	G	E	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	K	K	R	R	S	E	V	T	Q	E	A	D	F	Y	G	S	M	D	G	A	S	K	F	V	R	G	D	A	I	A	G	I	L	I	M	V	I	N	I	V	G	G	L	L	V	G	V	L	Q	H	G	M	S	M	G	H	A	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	Y	T	L	L	T	I	G	D	G	L	V	A	Q	I	P	A	L	V	I	S	T	A	A	G	V	I	V	T	R	V	S	T	D	Q	D	V	G	E	Q	M	V	N	Q	L	F	S	N	P	S	V	M	L	L	S	A	A	V	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	L	G	L	V	P	G	M	P	N	L	V	F	L	L	F	T	A	G	L	L	G	L	A	W	W	I	R	G	R	E	Q	K	A	P	A	E	P	K	P	V	K	M	A	E	N	N	T	V	V	E	A	T	W	N	D	V	Q	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	S	L	G	M	E	V	G	Y	R	L	I	P	M	V	D	F	Q	Q	D	G	E	L	L	G	R	I	R	S	I	R	K	K	F	A	Q	E	M	G	F	L	P	P	V	V	H	I	R	D	N	M	D	L	Q	P	A	R	Y	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?										?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	M	K	G	V	E	I	G	S	G	D	A	Y	P	G	R	W	L	A	I	N	P	G	T	A	A	G	T	L	P	G	E	A	T	V	D	P	A	F	G	L	N	A	I	W	I	E	S	A	L	K	E	Q	A	Q	I	Q	G	Y	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	V	E	A	S	T	V	V	A	T	H	L	N	H	L	I	S	Q	H	A	A	E	L	F	G	R	Q	E	A	Q	Q	L	L	D	R	V	A	Q	E	M	P	K	L	T	E	D	L	V	P	G	V	V	T	L	T	T	L	H	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	Q	N	L	L	D	E	K	V	P	I	R	D	M	R	T	I	L	E	T	L	A	E	H	A	P	I	Q	S	D	P	H	E	L	T	A	V	V	R	V	A	L	G	R	A	I	T	Q	Q	W	F	P	G	K	D	E	V	H	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		G	L	D	T	P	L	E	R	L	L	L	Q	A	L	Q	G	G	G	G	L	E	P	G	L	A	D	R	L	L	A	Q	T	Q	E	A	L	S	R	Q	E	M	L	G	A	P	P	V	L	L	V	N	H	A	L	R	P	L	L	S	R
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.
Sequence		F	L	R	R	S	L	P	Q	L	V	V	L	S	N	L	E	L	S	D	N	R	H	I	R	M	T	A	T	I	G	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand