Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76007 Date Thu Jan 5 12:17:17 GMT 2012 Unique Job ID c64e74c953cdb402

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	A	T	T	I	I	S	L	F	I	L	G	S	I	L	V	T	S	S	I	L	L	S	S	F	S	S	R	L	G	I	P	I	L	V	I	F	L	A	I	G	M	L	A	G	V	D	G	V	G	G	I	P	F	D	N	Y	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																													?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	Y	M	V	S	N	L	A	L	A	I	I	L	L	D	G	G	M	R	T	Q	A	S	S	F	R	V	A	L	G	P	A	L	S	L	A	T	L	G	V	L	I	T	S	G	L	T	G	M	M	A	A	W	L	F	N	L	D	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	G	L	L	I	G	A	I	V	G	S	T	D	A	A	A	V	F	S	L	L	G	G	K	G	L	N	E	R	V	G	S	T	L	E	I	E	S	G	S	N	D	P	M	A	V	F	L	T	I	T	L	I	A	M	I	Q	H	H	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?		?	?																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	N	I	S	W	M	F	I	V	D	I	L	Q	Q	F	G	L	G	I	V	I	G	L	G	G	G	Y	L	L	L	Q	M	I	N	R	I	A	L	P	A	G	L	Y	P	L	L	A	L	S	G	G	I	L	I	F	S	L	T	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	E	G	S	G	I	L	A	V	Y	L	C	G	F	L	L	G	N	R	P	I	R	N	R	Y	G	I	L	Q	N	F	D	G	L	A	W	L	A	Q	I	A	M	F	L	V	L	G	L	L	V	N	P	S	D	L	L	P	I	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	A	L	I	L	S	A	W	M	I	F	F	A	R	P	L	S	V	F	A	G	L	L	P	F	R	G	F	N	L	R	E	R	V	F	I	S	W	V	G	L	R	G	A	V	P	I	I	L	A	V	F	P	M	M	A	G	L	E	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	R	L	F	F	N	V	A	F	F	V	V	L	V	S	L	L	L	Q	G	T	S	L	S	W	A	A	K	K	A	K	V	V	V	P	P	V	G	R	P	V	S	R	V	G	L	D	I	H	P	E	N	P	W	E	Q	F	V	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	S	A	D	K	W	C	V	G	A	A	L	R	D	L	H	M	P	K	E	T	R	I	A	A	L	F	R	D	N	Q	L	L	H	P	T	G	S	T	R	L	R	E	G	D	V	L	C	V	I	G	R	E	R	D	L	P	A	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?				?																										?			?
Disorder confidence
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Sequence		K	L	F	S	Q	S	P	P	V	A	L	D	Q	R	F	F	G	D	F	I	L	E	A	S	A	K	Y	A	D	V	A	L	I	Y	G	L	E	D	G	R	E	Y	R	D	K	Q	Q	T	L	G	E	I	V	Q	Q	L	L	G	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?																		?	?	?	?	?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	V	V	G	D	Q	V	E	F	A	G	M	I	W	T	V	A	E	K	E	D	N	E	V	L	K	I	G	V	R	V	A	E	E	E	A	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?																													?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand