Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45800 Date Wed Jan 25 15:20:55 GMT 2012 Unique Job ID c4f2eb709e6db4f5

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	T	I	V	I	F	L	A	A	L	L	A	C	S	L	L	A	G	W	L	I	K	V	R	S	R	R	R	Q	L	P	W	T	N	A	F	A	D	A	Q	T	R	K	L	T	P	E	E	R	S	A	V	E	N	Y	L	E	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?		?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	Q	V	L	Q	V	P	G	P	T	G	A	S	A	A	P	I	S	L	A	L	N	A	E	S	N	N	V	M	M	L	T	H	A	I	T	R	Y	G	I	S	T	D	D	P	N	K	W	R	Y	Y	L	D	S	V	E	V	H	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?			?	?		?	?																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	F	W	E	Q	Y	I	N	D	E	N	T	V	E	L	I	H	T	D	S	L	P	L	V	I	S	L	N	G	H	T	L	Q	E	Y	M	Q	E	T	R	S	Y	A	L	Q	P	V	P	S	T	Q	A	S	I	R	G	E	E	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	I	E	L	L	N	I	R	K	E	T	H	E	E	Y	A	L	S	R	P	R	G	L	R	E	A	L	L	I	V	A	S	F	L	M	F	F	F	C	L	I	T	P	D	V	F	V	P	W	L	A	G	G	A	L	L	L	L	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	L	W	G	L	F	A	P	P	A	K	S	S	L	R	E	I	H	C	L	R	G	T	P	R	R	W	G	L	F	G	E	N	D	Q	E	Q	I	N	N	I	S	L	G	I	I	D	L	V	Y	P	A	H	W	Q	P	Y	I	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?		?	?		?	?																				?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	L	G	Q	Q	T	D	I	D	I	Y	L	D	R	H	V	V	R	Q	G	R	Y	L	S	L	H	D	E	V	K	N	F	P	L	Q	H	W	L	R	S	T	I	I	A	A	G	S	L	L	V	L	F	M	L	L	F	W	I	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	M	P	L	K	F	T	L	S	W	M	K	G	A	Q	T	I	E	A	T	S	V	K	Q	L	A	D	A	G	V	R	V	G	D	T	L	R	I	S	G	T	G	M	C	N	I	R	T	S	G	T	W	S	A	K	T	N	S	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?								?	?	?		?	?	?															?		?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	P	F	D	C	S	Q	I	I	W	N	D	A	R	S	L	P	L	P	E	S	E	L	V	N	K	A	T	A	L	T	E	A	V	N	R	Q	L	H	P	K	P	E	D	E	S	R	V	S	A	S	L	R	S	A	I	Q	K	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?		?	?	?	?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	V	L	L	D	D	F	G	D	I	V	L	K	T	A	D	L	C	S	A	K	D	D	C	V	R	L	K	N	A	L	V	N	L	G	N	S	K	D	W	D	A	L	V	K	R	A	N	A	G	K	L	D	G	V	N	V	L	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?												?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	V	S	A	E	S	L	D	N	L	V	A	T	S	T	A	P	F	I	T	H	E	T	A	R	A	A	Q	S	L	N	S	P	A	P	G	G	F	L	I	V	S	D	E	G	S	D	F	V	D	Q	P	W	P	S	A	S	L	Y	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?					?															?					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Y	P	P	Q	E	Q	W	N	A	F	Q	K	L	A	Q	M	L	M	H	T	P	F	N	A	E	G	I	V	T	K	I	F	T	D	A	N	G	T	Q	H	I	G	L	H	P	I	P	D	R	S	G	L	W	R	Y	L	S	T	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																?	?																									?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.
Sequence		L	L	L	T	M	L	G	S	A	I	Y	N	G	V	Q	A	W	R	R	Y	Q	R	H	R	T	R	M	M	E	I	Q	A	Y	Y	E	S	C	L	N	P	Q	L	I	T	P	S	E	S	L	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?																					?	?	?	?			?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand