Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77328 Date Thu Jan 5 12:27:47 GMT 2012 Unique Job ID c45367e6c11cc5f7

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	N	F	A	V	S	R	E	S	L	L	S	G	F	Q	W	F	F	F	I	F	C	N	T	V	V	V	P	P	T	L	L	S	A	F	Q	L	P	Q	S	S	L	L	T	L	T	Q	Y	A	F	L	A	T	A	L	A	C	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	A	F	C	G	H	R	R	A	I	M	E	G	P	G	G	L	W	W	G	T	I	L	T	I	T	L	G	E	A	S	R	G	T	P	I	N	D	I	A	T	S	L	A	V	G	I	A	L	S	G	V	L	T	M	L	I	G	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?														?	?	?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	L	G	H	R	L	A	R	L	F	T	P	S	V	M	V	L	F	M	L	M	L	G	A	Q	L	T	T	I	F	F	K	G	M	L	G	L	P	F	G	I	A	D	P	N	F	K	I	Q	L	P	P	F	A	L	S	V	A	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	L	V	L	A	M	I	I	F	L	P	Q	R	F	A	R	Y	G	L	L	V	G	T	I	T	G	W	L	L	W	Y	F	C	F	P	S	S	H	S	L	S	G	E	L	H	W	Q	W	F	P	L	G	S	G	G	A	L	S	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?		?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	I	L	T	A	V	I	T	G	L	V	N	I	S	N	T	Y	G	A	I	R	G	T	D	V	F	Y	P	Q	Q	G	A	G	N	T	R	Y	R	R	S	F	V	A	T	G	F	M	T	L	I	T	V	P	L	A	V	I	P	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?																					?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	F	V	S	S	I	G	L	L	T	Q	T	G	D	Y	T	R	R	S	F	I	Y	G	S	V	I	C	L	L	V	A	L	V	P	A	L	T	R	L	F	C	S	I	P	L	P	V	S	S	A	V	M	L	V	S	Y	L	P	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?											?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	S	A	L	V	F	S	Q	Q	I	T	F	T	A	R	N	I	Y	R	L	A	L	P	L	F	V	G	I	F	L	M	A	L	P	P	V	Y	L	Q	D	L	P	L	T	L	R	P	L	L	S	N	G	L	L	V	G	I	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Sequence		V	L	M	D	N	L	I	P	W	E	R	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand