Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P24082 Date Thu Jan 5 11:40:43 GMT 2012 Unique Job ID c4293149cc0b3a3a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	I	L	P	L	I	L	A	L	V	A	G	M	A	Q	A	D	S	N	S	D	Y	R	A	G	S	D	F	A	H	Q	I	K	G	Q	G	S	S	S	I	Q	G	F	K	P	Q	E	S	I	P	G	Y	N	A	N	P	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?														?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	K	Y	Y	G	G	V	T	A	G	G	D	G	G	L	K	N	D	G	T	T	E	W	A	T	G	E	T	G	K	T	I	T	E	S	F	M	N	K	P	K	D	I	L	S	P	D	A	P	F	I	Q	T	G	R	D	V	V	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?				?		?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	D	S	I	V	G	N	T	G	Q	Q	C	S	A	Q	E	I	S	R	S	E	Y	T	N	Y	T	C	E	R	D	L	Q	V	E	Q	Y	C	T	R	T	A	R	M	E	L	Q	G	S	T	T	W	E	T	R	T	L	E	Y	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?					?	?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	Q	L	P	A	R	E	V	N	G	Q	Y	V	V	S	I	T	S	P	V	T	G	E	I	V	D	A	H	Y	S	W	S	R	T	Y	L	Q	K	S	V	P	M	T	I	T	V	L	G	T	P	L	S	W	N	A	K	Y	S	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	S	F	T	P	V	Q	K	T	L	T	A	G	V	A	F	T	S	S	H	P	V	R	V	G	N	T	K	F	K	R	H	T	A	M	K	L	R	L	V	V	R	V	K	K	A	S	Y	T	P	Y	V	V	W	S	E	S	C	P	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	K	E	L	G	K	L	T	K	T	E	C	T	E	A	G	G	N	R	T	L	V	K	D	G	Q	S	Y	S	M	Y	Q	S	C	W	A	Y	R	D	T	Y	V	T	Q	S	A	D	K	G	T	C	Q	T	Y	T	D	N	P	A	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?	?	?		?			?									?		?																	?						?	?	?	?						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	L	V	S	H	Q	C	A	F	Y	S	E	E	G	A	C	L	H	E	Y	A	T	Y	S	C	E	S	K	T	S	G	K	V	M	V	C	G	G	D	V	F	C	L	D	G	E	C	D	K	A	Q	S	G	K	S	N	D	F	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	V	S	Q	L	A	A	L	A	A	A	G	K	D	V	A	A	L	N	G	V	D	V	R	A	F	T	G	Q	A	K	F	C	K	K	A	A	A	G	Y	S	N	C	C	K	D	S	G	W	G	Q	D	I	G	L	A	K	C	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?									?	?			?															?		?	?					?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	E	K	A	L	A	K	A	K	S	N	K	L	T	V	S	V	G	E	F	C	S	K	K	V	L	G	V	C	L	E	K	K	R	S	Y	C	Q	F	D	S	K	L	A	Q	I	V	Q	Q	Q	G	R	N	G	Q	L	R	I	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?																																															?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	S	A	K	H	P	D	C	R	G	I	T	V	D	E	L	Q	K	I	Q	F	N	R	L	D	F	T	N	F	Y	E	D	L	M	N	N	Q	K	I	P	D	S	G	V	L	T	Q	K	V	K	E	Q	I	A	D	Q	L	K	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?																														?	?	?	?	?	?	?																	?	?
Disorder confidence
		.	.
Sequence		G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand