Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37636 Date Thu Jan 5 11:56:08 GMT 2012 Unique Job ID c423edb132c55891

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	R	R	R	K	L	L	I	P	L	L	F	C	G	A	M	L	T	A	C	D	D	K	S	A	E	N	A	A	A	M	T	P	E	V	G	V	V	T	L	S	P	G	S	V	N	V	L	S	E	L	P	G	R	T	V	P	Y	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?			?		?	?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	A	E	I	R	P	Q	V	G	G	I	I	I	K	R	N	F	I	E	G	D	K	V	N	Q	G	D	S	L	Y	Q	I	D	P	A	P	L	Q	A	E	L	N	S	A	K	G	S	L	A	K	A	L	S	T	A	S	N	A	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	F	N	R	Q	A	S	L	L	K	T	N	Y	V	S	R	Q	D	Y	D	T	A	R	T	Q	L	N	E	A	E	A	N	V	T	V	A	K	A	A	V	E	Q	A	T	I	N	L	Q	Y	A	N	V	T	S	P	I	T	G	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	K	S	S	V	T	V	G	A	L	V	T	A	N	Q	A	D	S	L	V	T	V	Q	R	L	D	P	I	Y	V	D	L	T	Q	S	V	Q	D	F	L	R	M	K	E	E	V	A	S	G	Q	I	K	Q	V	Q	G	S	T	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?				?	?	?			?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	L	N	L	E	N	G	K	R	Y	S	Q	T	G	T	L	K	F	S	D	P	T	V	D	E	T	T	G	S	V	T	L	R	A	I	F	P	N	P	N	G	D	L	L	P	G	M	Y	V	T	A	L	V	D	E	G	S	R	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?											?	?		?	?	?																													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	L	L	V	P	Q	E	G	V	T	H	N	A	Q	G	K	A	T	A	L	I	L	D	K	D	D	V	V	Q	L	R	E	I	E	A	S	K	A	I	G	D	Q	W	V	V	T	S	G	L	Q	A	G	D	R	V	I	V	S	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Sequence		Q	R	I	R	P	G	I	K	A	R	A	I	S	S	S	Q	E	N	A	S	T	E	S	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand