36 c1hciB_ Probab=79.98   E-value=2.6  Score=17.64  Aligned_columns=300  Identities=8%

Q ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf             99999999999999999999999999999999999999999999988657766567677899999865433434678764
Q batch____        24 LTSSLVKMTQAGETAANSAGKVTKATEDEKNALAKLKAAIDPVGAAIDTVGRRYSELKKFFDKGLIDKEEYEFLVRKLNE  103 (342)
Q Consensus        24 L~~~l~~l~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~  103 (342)
                      +...+..+..........+.........+...+..+...+..+...+................+................
T Consensus       100 ~~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~e~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~  179 (475)
T c1hciB_         100 IAGAWQRLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLEHLAEKFRQKASTHETWAYGKEQILLQKDYESASLTEVRALLRKHEAFESD  179 (475)
T ss_dssp             HHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHCCGGGSCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf             99999989999999999999999989999999999999999999999999988841011138989999999988987887


Q ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf             79987555899999999989999986300788997665467776543335555421234577777543233577665366
Q batch____       104 TTEELSGVAQAQREAEKAGKLAAAQQEAQAQAFQRMLDKIDPLAAALRNLEQQHDELNAAFASGKINGSQFENYSRKIQE  183 (342)
Q Consensus       104 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~  183 (342)
                      ...............................................................+......+......+..
T Consensus       180 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~  259 (475)
T c1hciB_         180 LAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYHDAVNVNDRCQKICDQWDRLGTLTQKRREALERMEKLLETIDQLHLEFAKRAAPFNN  259 (475)
T ss_dssp             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf             76432223557764333430581226789999999997656666522224888766799999988999898888776543


Q ss_pred             HHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------HHHHHHH
Q ss_conf             6766455556666--6543323367764322788999997432258899999999999---------------9999999
Q batch____       184 TRRELTGEAQAER--EAAKAHDEQVVALQRLIAQLDPVGTAFNRLVEQQKQLNEAKAK---------------GMLSPEM  246 (342)
Q Consensus       184 ~~~~~~~~~~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~---------------~~~~~~~  246 (342)
                      .............  .............................+......+......               ...+...
T Consensus       260 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~  339 (475)
T c1hciB_         260 WMEGAMEDLQDMFIVHSIEEIQSLITAHEQFKATLPEADGERQSIMAIQNEVEKVIQSYNIRISSSNPYSTVTMDELRTK  339 (475)
T ss_dssp             HHHHHHHHTTCCCCCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCCSCSCCTTCSSCHHHHHHH
T ss_pred             HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf             23445653012001278898898999997678999999999999998765678886521014402489999999999999


Q ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf             999999999999999999999999999999999999999999999999998202899-99999998899999999997
Q batch____       247 YEELSGKLRAMRSELEVTQSQLSKTGMSAKQTAFAMRMLPAQMTDIVVGLSTGQSPF-MVLMQQGGHSAMQETRIASL  323 (342)
Q Consensus       247 ~~~l~~~l~~~~~~l~~~~~ql~~~~~~~~~~~~~l~~l~~ql~dl~~~L~~~~~~l-~~l~~q~~~~~~~~~~l~~l  323 (342)
                      +..+...+......+......+.........+...+..+...+.+....+....... ..+..+..++......|..+
T Consensus       340 ~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~l~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~l~~el~~~  417 (475)
T c1hciB_         340 WDKVKQLVPIRDQSLQEELARQHANERLRRQFAAQANAIGPWIQNKMEEIARSSIQITGALEDQMNQLKQYEHNIINY  417 (475)
T ss_dssp             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSCTTTTSTHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf             999999999999999999999998557899999999999999999999988642322798999999999999999999