Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77221 Date Thu Jan 5 12:26:33 GMT 2012 Unique Job ID c338bc5a3c191341

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	Q	S	L	F	S	Q	P	L	N	V	I	N	V	G	I	A	M	F	S	D	D	L	K	K	Q	H	V	E	V	T	Q	L	D	W	T	P	P	G	Q	G	N	M	Q	V	V	Q	A	L	D	N	I	A	D	S	P	L	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																			?	?														?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	I	A	A	A	N	Q	Q	A	L	E	R	I	I	Q	S	H	P	V	L	I	G	F	D	Q	A	I	N	V	V	P	G	M	T	A	K	T	I	L	H	A	G	P	P	I	T	W	E	K	M	C	G	A	M	K	G	A	V	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	L	V	F	E	G	L	A	K	D	L	D	E	A	A	E	L	A	A	S	G	E	I	T	F	S	P	C	H	E	H	D	C	V	G	S	M	A	G	V	T	S	A	S	M	F	M	H	I	V	K	N	K	T	Y	G	N	I	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	N	M	S	E	Q	M	A	K	I	L	R	M	G	A	N	D	Q	S	V	I	D	R	L	N	W	M	R	D	V	Q	G	P	I	L	R	D	A	M	K	I	I	G	E	I	D	L	R	L	M	L	A	Q	A	L	H	M	G	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		C	H	N	R	N	N	A	G	T	T	L	L	I	Q	A	L	T	P	G	I	I	Q	A	G	Y	S	V	E	Q	Q	R	E	V	F	E	F	V	A	S	S	D	Y	F	S	G	P	T	W	M	A	M	C	K	A	A	M	D	A	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?					?	?	?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	I	E	Y	S	T	V	V	T	T	M	A	R	N	G	V	E	F	G	L	R	V	S	G	L	P	G	Q	W	F	T	G	P	A	Q	Q	V	I	G	P	M	F	A	G	Y	K	P	E	D	S	G	L	D	I	G	D	S	A	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																								?																							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	T	Y	G	I	G	G	F	A	M	A	T	A	P	A	I	V	A	L	V	G	G	T	V	E	E	A	I	D	F	S	R	Q	M	R	E	I	T	L	G	E	N	P	N	V	T	I	P	L	L	G	F	M	G	V	P	S	A	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?								?	?															?					?								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Sequence		I	T	R	V	G	S	S	G	I	L	P	V	I	N	T	A	I	A	H	K	D	A	G	V	G	M	I	G	A	G	I	V	H	P	P	F	A	C	F	E	K	A	I	L	G	W	C	E	R	Y	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?		?	?	?	?	?	?																									?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand