Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABZ6 Date Thu Jan 5 11:16:47 GMT 2012 Unique Job ID c22629b8a1e2112e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	N	W	K	T	L	L	L	G	I	A	M	I	A	N	T	S	F	A	A	P	Q	V	V	D	K	V	A	A	V	V	N	N	G	V	V	L	E	S	D	V	D	G	L	M	Q	S	V	K	L	N	A	A	Q	A	R	Q	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	D	D	A	T	L	R	H	Q	I	M	E	R	L	I	M	D	Q	I	I	L	Q	M	G	Q	K	M	G	V	K	I	S	D	E	Q	L	D	Q	A	I	A	N	I	A	K	Q	N	N	M	T	L	D	Q	M	R	S	R	L	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																									?	?	?	?	?																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	G	L	N	Y	N	T	Y	R	N	Q	I	R	K	E	M	I	I	S	E	V	R	N	N	E	V	R	R	R	I	T	I	L	P	Q	E	V	E	S	L	A	Q	Q	V	G	N	Q	N	D	A	S	T	E	L	N	L	S	H	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																								?	?	?	?		?	?															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	P	L	P	E	N	P	T	S	D	Q	V	N	E	A	E	S	Q	A	R	A	I	V	D	Q	A	R	N	G	A	D	F	G	K	L	A	I	A	H	S	A	D	Q	Q	A	L	N	G	G	Q	M	G	W	G	R	I	Q	E	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?																				?			?										?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	I	F	A	Q	A	L	S	T	A	K	K	G	D	I	V	G	P	I	R	S	G	V	G	F	H	I	L	K	V	N	D	L	R	G	E	S	K	N	I	S	V	T	E	V	H	A	R	H	I	L	L	K	P	S	P	I	M	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?			?																?		?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	Q	A	R	V	K	L	E	Q	I	A	A	D	I	K	S	G	K	T	T	F	A	A	A	A	K	E	F	S	Q	D	P	G	S	A	N	Q	G	G	D	L	G	W	A	T	P	D	I	F	D	P	A	F	R	D	A	L	T	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	K	G	Q	M	S	A	P	V	H	S	S	F	G	W	H	L	I	E	L	L	D	T	R	N	V	D	K	T	D	A	A	Q	K	D	R	A	Y	R	M	L	M	N	R	K	F	S	E	E	A	A	S	W	M	Q	E	Q	R	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	Y	V	K	I	L	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand