Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P21420 Date Thu Jan 5 11:38:19 GMT 2012 Unique Job ID c11ca4649bab08d8

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	K	L	T	V	A	I	S	A	V	A	A	S	V	L	M	A	M	S	A	Q	A	A	E	I	Y	N	K	D	S	N	K	L	D	L	Y	G	K	V	N	A	K	H	Y	F	S	S	N	D	A	D	D	G	D	T	T	Y	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?															?	?	?	?																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	G	F	K	G	E	T	Q	I	N	D	Q	L	T	G	F	G	Q	W	E	Y	E	F	K	G	N	R	A	E	S	Q	G	S	S	K	D	K	T	R	L	A	F	A	G	L	K	F	G	D	Y	G	S	I	D	Y	G	R	N	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	A	Y	D	I	G	A	W	T	D	V	L	P	E	F	G	G	D	T	W	T	Q	T	D	V	F	M	T	Q	R	A	T	G	V	A	T	Y	R	N	N	D	F	F	G	L	V	D	G	L	N	F	A	A	Q	Y	Q	G	K	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?																																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	S	D	F	D	N	Y	T	E	G	N	G	D	G	F	G	F	S	A	T	Y	E	Y	E	G	F	G	I	G	A	T	Y	A	K	S	D	R	T	D	T	Q	V	N	A	G	K	V	L	P	E	V	F	A	S	G	K	N	A	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		W	A	A	G	L	K	Y	D	A	N	N	I	Y	L	A	T	T	Y	S	E	T	Q	N	M	T	V	F	A	D	H	F	V	A	N	K	A	Q	N	F	E	A	V	A	Q	Y	Q	F	D	F	G	L	R	P	S	V	A	Y	L	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	G	K	D	L	G	V	W	G	D	Q	D	L	V	K	Y	V	D	V	G	A	T	Y	Y	F	N	K	N	M	S	T	F	V	D	Y	K	I	N	L	L	D	K	N	D	F	T	K	A	L	G	V	S	T	D	D	I	V	A	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		L	V	Y	Q	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand