Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76224 Date Thu Jan 5 12:20:51 GMT 2012 Unique Job ID c08a9f1644db00d3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	T	P	L	R	Y	A	L	I	F	L	L	W	A	M	V	A	V	I	Y	A	P	L	I	P	A	A	L	T	L	I	S	P	A	L	S	L	T	H	W	Q	A	L	F	A	D	P	Q	L	P	Q	A	L	L	A	T	L	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																						?	?				?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	T	I	A	A	V	G	A	L	L	I	A	L	L	V	I	V	A	L	W	P	G	P	K	W	Q	R	M	C	A	R	L	P	W	L	L	A	I	P	H	V	A	F	A	T	S	A	L	L	L	F	A	D	G	G	L	L	Y	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	P	Y	F	T	P	P	M	D	R	F	G	I	G	L	G	L	T	L	A	V	K	E	S	A	F	L	L	W	I	L	A	A	V	L	S	E	K	W	L	L	Q	Q	V	I	V	L	D	S	L	G	Y	S	R	W	Q	C	L	N	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?			?	?																													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	L	L	P	S	V	A	P	A	L	A	M	A	M	L	A	I	V	A	W	S	L	S	V	V	D	V	A	I	I	L	G	P	G	N	P	P	T	L	A	V	I	S	W	Q	W	L	T	Q	G	D	I	D	Q	Q	T	K	G	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	S	L	L	L	M	L	L	L	A	A	Y	V	L	L	S	Y	L	L	W	R	S	W	R	R	T	I	P	R	V	D	G	V	R	K	P	A	T	P	L	L	P	G	N	T	L	A	I	F	L	P	L	T	G	V	L	C	V	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	A	I	L	A	D	Q	S	T	I	N	S	E	A	L	I	N	S	L	T	M	G	L	V	A	T	F	I	A	L	L	L	L	L	L	W	L	E	W	G	P	Q	R	R	Q	L	W	L	W	L	P	I	L	L	P	A	L	P	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?																												?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	G	Q	Y	T	L	A	L	W	L	K	L	D	G	S	W	T	A	V	V	W	G	H	L	L	W	V	M	P	W	M	L	F	I	L	Q	P	A	W	Q	R	I	D	S	R	L	I	L	I	A	Q	T	L	G	W	S	R	A	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	F	Y	V	K	C	P	L	M	L	R	P	V	L	I	A	F	A	V	G	F	A	V	G	I	A	Q	Y	M	P	T	L	W	L	G	A	G	R	F	P	T	L	T	T	E	A	V	A	L	S	S	G	G	S	N	G	I	L	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?		?														?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Sequence		Q	A	L	W	Q	L	L	L	P	L	I	I	F	A	L	T	A	L	V	A	K	W	V	G	Y	V	R	Q	G	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand