Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77286 Date Thu Jan 5 12:27:14 GMT 2012 Unique Job ID bfe273203159786f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	S	E	G	G	K	P	G	N	V	L	T	V	N	G	N	Y	T	G	N	N	G	L	M	T	F	N	A	T	L	G	G	D	N	S	P	T	D	K	M	N	V	K	G	D	T	Q	G	N	T	R	V	R	V	D	N	I	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?																									?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	G	A	Q	T	V	N	G	I	E	L	I	E	V	G	G	N	S	A	G	N	F	A	L	T	T	G	T	V	E	A	G	A	Y	V	Y	T	L	A	K	G	K	G	N	D	E	K	N	W	Y	L	T	S	K	W	D	G	V	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																				?															?	?	?	?		?	?								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	D	T	P	D	P	I	N	N	P	P	V	V	D	P	E	G	P	S	V	Y	R	P	E	A	G	S	Y	I	S	N	I	A	A	A	N	S	L	F	S	H	R	L	H	D	R	L	G	E	P	Q	Y	T	D	S	L	H	S	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	A	S	S	M	W	M	R	H	V	G	G	H	E	R	S	R	A	G	D	G	Q	L	N	T	Q	A	N	R	Y	V	L	Q	L	G	G	D	L	A	Q	W	S	S	N	A	Q	D	R	W	H	L	G	V	M	A	G	Y	A	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	S	N	T	Q	S	N	R	V	G	Y	K	S	D	G	R	I	S	G	Y	S	A	G	L	Y	A	T	W	Y	Q	N	D	A	N	K	T	G	A	Y	V	D	S	W	A	L	Y	N	W	F	D	N	S	V	S	S	D	N	R	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																			?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	D	Y	D	S	R	G	V	T	A	S	V	E	G	G	Y	T	F	E	A	G	T	F	S	G	S	E	G	T	L	N	T	W	Y	V	Q	P	Q	A	Q	I	T	W	M	G	V	K	D	S	D	H	T	R	K	D	G	T	R	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?		?	?															?				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	E	G	D	G	N	V	Q	T	R	L	G	V	K	T	Y	L	N	S	H	H	Q	R	D	D	G	K	Q	R	E	F	Q	P	Y	I	E	A	N	W	I	N	N	S	K	V	Y	A	V	K	M	N	G	Q	T	V	G	R	E	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																	?	?		?	?	?	?																									?			?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	N	L	G	E	V	R	T	G	V	E	A	K	V	N	N	N	L	S	L	W	G	N	V	G	V	Q	L	G	D	K	G	Y	S	D	T	Q	G	M	L	G	V	K	Y	S	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand