Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q47706 Date Thu Jan 5 12:37:07 GMT 2012 Unique Job ID bf480df354926da9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	K	I	V	A	M	A	V	I	C	L	T	A	A	S	G	L	T	S	A	Y	A	A	Q	L	A	D	D	E	A	G	L	R	I	R	L	K	N	E	L	R	R	A	D	K	P	S	A	G	A	G	R	D	I	Y	A	W	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	G	L	L	D	F	N	S	G	Y	Y	S	N	I	I	G	V	E	G	G	A	Y	Y	V	Y	K	L	G	A	R	A	D	M	S	T	R	W	Y	L	D	G	D	K	S	F	G	F	A	L	G	A	V	K	I	K	P	S	E	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	K	L	G	R	F	G	T	D	Y	S	Y	G	S	L	P	Y	R	I	P	L	M	A	G	S	S	Q	R	T	L	P	T	V	S	E	G	A	L	G	Y	W	A	L	T	P	N	I	D	L	W	G	M	W	R	S	R	V	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?		?		?					?	?	?											?	?	?	?		?																							?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	T	D	S	T	T	G	I	R	D	E	G	V	Y	N	S	Q	T	G	K	Y	D	K	H	R	A	R	S	F	L	A	A	S	W	H	D	D	T	S	R	Y	S	L	G	A	S	V	Q	K	D	V	S	N	Q	I	Q	S	I	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?		?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	S	I	P	L	D	P	N	Y	T	L	K	G	E	L	L	G	F	Y	A	Q	L	E	G	L	S	R	N	T	S	Q	P	N	E	T	A	L	V	S	G	Q	L	T	W	N	A	P	W	G	S	V	F	G	S	G	G	Y	L	R	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?																?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	M	N	G	A	V	V	D	T	D	I	G	Y	P	F	S	L	S	L	D	R	N	R	E	G	M	Q	S	W	Q	L	G	V	N	Y	R	L	T	P	Q	F	T	L	T	F	A	P	I	V	T	R	G	Y	E	S	S	K	R	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?															?	?	?	?	?																?	?	?	?		?									?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	I	E	G	T	G	I	L	G	G	M	N	Y	R	V	S	E	G	P	L	Q	G	M	N	F	F	L	A	A	D	K	G	R	E	K	R	D	G	S	T	L	G	D	R	L	N	Y	W	D	V	K	M	S	I	Q	Y	D	F	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?												?				?
Disorder confidence
		.
Sequence		K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand