Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P30015 Date Wed Jan 25 15:20:48 GMT 2012 Unique Job ID be13e6f9a5261a33

Secondary structure and disorder prediction

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Sequence		M	A	D	N	P	D	P	S	S	L	L	P	D	V	F	S	P	A	T	R	D	W	F	L	R	A	F	K	Q	P	T	A	V	Q	P	Q	T	W	H	V	A	A	R	S	E	H	A	L	V	I	A	P	T	G	S	G	K	T	L	A
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Disorder		?	?	?	?	?	?
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Sequence		A	F	L	Y	A	L	D	R	L	F	R	E	G	G	E	D	T	R	E	A	H	K	R	K	T	S	R	I	L	Y	I	S	P	I	K	A	L	G	T	D	V	Q	R	N	L	Q	I	P	L	K	G	I	A	D	E	R	R	R	R	G
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Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?		?	?	?
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Sequence		E	T	E	V	N	L	R	V	G	I	R	T	G	D	T	P	A	Q	E	R	S	K	L	T	R	N	P	P	D	I	L	I	T	T	P	E	S	L	Y	L	M	L	T	S	R	A	R	E	T	L	R	G	V	E	T	V	I	I	D	E
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Disorder		?
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Sequence		V	H	A	V	A	G	S	K	R	G	A	H	L	A	L	S	L	E	R	L	D	A	L	L	H	T	S	A	Q	R	I	G	L	S	A	T	V	R	S	A	S	D	V	A	A	F	L	G	G	D	R	P	V	T	V	V	N	P	P	A
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SS confidence
Disorder
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Sequence		M	R	H	P	Q	I	R	I	V	V	P	V	A	N	M	D	D	V	S	S	V	A	S	G	T	G	E	D	S	H	A	G	R	E	G	S	I	W	P	Y	I	E	T	G	I	L	D	E	V	L	R	H	R	S	T	I	V	F	T	N
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Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	R	G	L	A	E	K	L	T	A	R	L	N	E	L	Y	A	A	R	L	Q	R	S	P	S	I	A	V	D	A	A	H	F	E	S	T	S	G	A	T	S	N	R	V	Q	S	S	D	V	F	I	A	R	S	H	H	G	S	V	S
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Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	E	Q	R	A	I	T	E	Q	A	L	K	S	G	E	L	R	C	V	V	A	T	S	S	L	E	L	G	I	D	M	G	A	V	D	L	V	I	Q	V	A	T	P	L	S	V	A	S	G	L	Q	R	I	G	R	A	G	H	Q	V
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Sequence		G	G	V	S	K	G	L	F	F	P	R	T	R	R	D	L	V	D	S	A	V	I	V	E	C	M	F	A	G	R	L	E	N	L	T	P	P	H	N	P	L	D	V	L	A	Q	Q	T	V	A	A	A	A	M	D	A	L	Q	V	D
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Sequence		E	W	Y	S	R	V	R	R	A	A	P	W	K	D	L	P	R	R	V	F	D	A	T	L	D	M	L	S	G	R	Y	P	S	G	D	F	S	A	F	R	P	K	L	V	W	N	R	E	T	G	I	L	T	A	R	P	G	A	Q	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	A	V	T	S	G	G	T	I	P	D	R	G	M	Y	S	V	L	L	P	E	G	E	E	K	A	G	S	R	R	V	G	E	L	D	E	E	M	V	Y	E	S	R	V	N	D	I	I	T	L	G	A	T	S	W	R	I	Q	Q	I
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Sequence		T	R	D	Q	V	I	V	T	P	A	P	G	R	S	A	R	L	P	F	W	R	G	E	G	N	G	R	P	A	E	L	G	E	M	I	G	D	F	L	H	L	L	A	D	G	A	F	F	S	G	T	I	P	P	W	L	A	E	E	N
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		T	I	A	N	I	Q	G	L	I	E	E	Q	R	N	A	T	G	I	V	P	G	S	R	H	L	V	L	E	R	C	R	D	E	I	G	D	W	R	I	I	L	H	S	P	Y	G	R	R	V	H	E	P	W	A	V	A	I	A	G	R
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		I	H	A	L	W	G	A	D	A	S	V	V	A	S	D	D	G	I	V	A	R	I	P	D	T	D	G	K	L	P	D	A	A	I	F	L	F	E	P	E	K	L	L	Q	I	V	R	E	A	V	G	S	S	A	L	F	A	A	R	F
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Disorder																									?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		R	E	C	A	A	R	A	L	L	M	P	G	R	T	P	G	H	R	T	P	L	W	Q	Q	R	L	R	A	S	Q	L	L	E	I	A	Q	G	Y	P	D	F	P	V	I	L	E	T	L	R	E	C	L	Q	D	V	Y	D	L	P	A
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Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		L	E	R	L	M	R	R	L	N	G	G	E	I	Q	I	S	D	V	T	T	T	T	P	S	P	F	A	T	S	L	L	F	G	Y	V	A	E	F	M	Y	Q	S	D	A	P	L	A	E	R	R	A	S	V	L	S	L	D	S	E	L
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Disorder																					?	?		?			?													?	?				?	?	?										?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		L	R	N	L	L	G	Q	V	D	P	G	E	L	L	D	P	Q	V	I	R	Q	V	E	E	E	L	Q	R	L	A	P	G	R	R	A	K	G	E	E	G	L	F	D	L	L	R	E	L	G	P	M	T	V	E	D	L	A	Q	R	H
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Sequence		T	G	S	S	E	E	V	A	S	Y	L	E	N	L	L	A	V	K	R	I	F	P	A	M	I	S	G	Q	E	R	L	A	C	M	D	D	A	A	R	L	R	D	A	L	G	V	R	L	P	E	S	L	P	E	I	Y	L	H	R	V
Secondary structure
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Disorder																																																?			?				?	?	?
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Sequence		S	Y	P	L	R	D	L	F	L	R	Y	L	R	A	H	A	L	V	T	A	E	Q	L	A	H	E	F	S	L	G	I	A	I	V	E	E	Q	L	Q	Q	L	R	E	Q	G	L	V	M	N	L	Q	Q	D	I	W	V	S	D	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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Sequence		F	R	R	L	R	L	R	S	L	Q	A	A	R	E	A	T	R	P	V	A	A	T	T	Y	A	R	L	L	L	E	R	Q	G	V	L	P	A	T	D	G	S	P	A	L	F	A	S	T	S	P	G	V	Y	E	G	V	D	G	V	M
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SS confidence
Disorder																																			?		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		R	V	I	E	Q	L	A	G	V	G	L	P	A	S	L	W	E	S	Q	I	L	P	A	R	V	R	D	Y	S	S	E	M	L	D	E	L	L	A	T	G	A	V	I	W	S	G	Q	K	K	L	G	E	D	D	G	L	V	A	L	H
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SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		L	Q	E	Y	A	A	E	S	F	T	P	A	E	A	D	Q	A	N	R	S	A	L	Q	Q	A	I	V	A	V	L	A	D	G	G	A	W	F	A	Q	Q	I	S	Q	R	I	R	D	K	I	G	E	S	V	D	L	S	A	L	Q	E
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
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Sequence		A	L	W	A	L	V	W	Q	G	V	I	T	S	D	I	W	A	P	L	R	A	L	T	R	S	S	S	N	A	R	T	S	T	R	R	S	H	R	A	R	R	G	R	P	V	Y	A	Q	P	V	S	P	R	V	S	Y	N	T	P	N
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SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		L	A	G	R	W	S	L	L	Q	V	E	P	L	N	D	T	E	R	M	L	A	L	A	E	N	M	L	D	R	Y	G	I	I	S	R	Q	A	V	I	A	E	N	I	P	G	G	F	P	S	M	Q	T	L	C	R	S	M	E	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?								?	?	?	?	?	?																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		G	R	I	M	R	G	R	F	V	E	G	L	G	G	A	Q	F	A	E	R	L	T	I	D	R	L	R	D	L	A	T	Q	A	T	Q	T	R	H	Y	T	P	V	A	L	S	A	N	D	P	A	N	V	W	G	N	L	L	P	W	P
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SS confidence
Disorder																														?		?	?	?	?	?
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Sequence		A	H	P	A	T	L	V	P	T	R	R	A	G	A	L	V	V	V	S	G	G	K	L	L	L	Y	L	A	Q	G	G	K	K	M	L	V	W	Q	E	K	E	E	L	L	A	P	E	V	F	H	A	L	T	T	A	L	R	R	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	L	R	F	T	L	T	E	V	N	D	L	P	V	R	Q	T	P	M	F	T	L	L	R	E	A	G	F	S	S	S	P	Q	G	L	D	W	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?
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