Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46861 Date Wed Jan 25 15:21:13 GMT 2012 Unique Job ID bda536a21ea3ddfb

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	I	S	L	I	Q	P	D	R	D	L	F	S	W	P	Q	Y	W	A	A	C	F	G	P	A	P	F	L	P	M	S	R	E	E	M	D	Q	L	G	W	D	S	C	D	I	I	L	V	T	G	D	A	Y	V	D	H	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?								?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	G	M	A	I	C	G	R	M	L	E	A	Q	G	F	R	V	G	I	I	A	Q	P	D	W	S	S	K	D	D	F	M	R	L	G	K	P	N	L	F	F	G	V	T	A	G	N	M	D	S	M	I	N	R	Y	T	A	D	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	R	H	D	D	A	Y	T	P	D	N	V	A	G	K	R	P	D	R	A	T	L	V	Y	T	Q	R	C	K	E	A	W	K	D	V	P	V	I	L	G	G	I	E	A	S	L	R	R	T	A	H	Y	D	Y	W	S	D	T	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	S	V	L	V	D	S	K	A	D	M	L	M	F	G	N	G	E	R	P	L	V	E	V	A	H	R	L	A	M	G	E	P	I	S	E	I	R	D	V	R	N	T	A	I	I	V	K	E	A	L	P	G	W	S	G	V	D	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?			?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	L	D	T	P	G	K	I	D	P	I	P	H	P	Y	G	E	D	L	P	C	A	D	N	K	P	V	A	P	K	K	Q	E	A	K	A	V	T	V	Q	P	P	R	P	K	P	W	E	K	T	Y	V	L	L	P	S	F	E	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	G	D	K	V	L	Y	A	H	A	S	R	I	L	H	H	E	T	N	P	G	C	A	R	A	L	M	Q	K	H	G	D	R	Y	V	W	I	N	P	P	A	I	P	L	S	T	E	E	M	D	S	V	F	A	L	P	Y	K	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																								?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	H	P	A	Y	G	N	A	R	I	P	A	Y	E	M	I	R	F	S	V	N	I	M	R	G	C	F	G	G	C	S	F	C	S	I	T	E	H	E	G	R	I	I	Q	S	R	S	E	D	S	I	I	N	E	I	E	A	I	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?				?																												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	V	P	G	F	T	G	V	I	S	D	L	G	G	P	T	A	N	M	Y	M	L	R	C	K	S	P	R	A	E	Q	T	C	R	R	L	S	C	V	Y	P	D	I	C	P	H	M	D	T	N	H	E	P	T	I	N	L	Y	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	R	D	L	K	G	I	K	K	I	L	I	A	S	G	V	R	Y	D	I	A	V	E	D	P	R	Y	I	K	E	L	A	T	H	H	V	G	G	Y	L	K	I	A	P	E	H	T	E	E	G	P	L	S	K	M	M	K	P	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	S	Y	D	R	F	K	E	L	F	D	T	Y	S	K	Q	A	G	K	E	Q	Y	L	I	P	Y	F	I	S	A	H	P	G	T	R	D	E	D	M	V	N	L	A	L	W	L	K	K	H	R	F	R	L	D	Q	V	Q	N	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		P	S	P	L	A	N	S	T	T	M	Y	Y	T	G	K	N	P	L	A	K	I	G	Y	K	S	E	D	V	F	V	P	K	G	D	K	Q	R	R	L	H	K	A	L	L	R	Y	H	D	P	A	N	W	P	L	I	R	Q	A	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?		?	?	?	?	?	?					?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		A	M	G	K	K	H	L	I	G	S	R	R	D	C	L	V	P	A	P	T	I	E	E	M	R	E	A	R	R	Q	N	R	N	T	R	P	A	L	T	K	H	T	P	M	A	T	Q	R	Q	T	P	A	T	A	K	K	A	S	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	S	R	P	V	N	A	G	A	K	K	R	P	K	A	A	V	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand