Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P22729 Date Wed Jan 25 15:20:42 GMT 2012 Unique Job ID bd69bae189549580

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	P	M	H	I	A	M	A	L	L	S	A	A	M	F	F	V	L	A	G	V	F	M	G	V	Q	L	E	L	D	G	T	K	L	V	V	D	T	A	S	D	V	R	W	Q	W	V	F	I	G	T	A	V	V	F	F	F	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																					?	?	?	?	?		?	?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	R	P	A	F	Q	K	G	L	K	S	V	S	G	P	K	F	I	L	P	A	I	D	G	S	T	V	K	Q	K	L	F	L	V	A	L	L	V	L	A	V	A	W	P	F	M	V	S	R	G	T	V	D	I	A	T	L	T	M	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	I	I	L	G	L	G	L	N	V	V	V	G	L	S	G	L	L	V	L	G	Y	G	G	F	Y	A	I	G	A	Y	T	F	A	L	L	N	H	Y	Y	G	L	G	F	W	T	C	L	P	I	A	G	L	M	A	A	A	A	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	L	G	F	P	V	L	R	L	R	G	D	Y	L	A	I	V	T	L	G	F	G	E	I	V	R	I	L	L	L	N	N	T	E	I	T	G	G	P	N	G	I	S	Q	I	P	K	P	T	L	F	G	L	E	F	S	R	T	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?							?	?	?		?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	G	G	W	D	T	F	S	N	F	F	G	L	K	Y	D	P	S	D	R	V	I	F	L	Y	L	V	A	L	L	L	V	V	L	S	L	F	V	I	N	R	L	L	R	M	P	L	G	R	A	W	E	A	L	R	E	D	E	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		C	R	S	L	G	L	S	P	R	R	I	K	L	T	A	F	T	I	S	A	A	F	A	G	F	A	G	T	L	F	A	A	R	Q	G	F	V	S	P	E	S	F	T	F	A	E	S	A	F	V	L	A	I	V	V	L	G	G	M	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	Q	F	A	V	I	L	A	A	I	L	L	V	V	S	R	E	L	M	R	D	F	N	E	Y	S	M	L	M	L	G	G	L	M	V	L	M	M	I	W	R	P	Q	G	L	L	P	M	T	R	P	Q	L	K	L	K	N	G	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		K	G	E	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand