Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P26218 Date Thu Jan 5 11:42:49 GMT 2012 Unique Job ID bd050d39ca05dc13

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	R	R	N	L	I	T	S	A	I	L	L	M	A	P	L	A	F	S	A	Q	S	L	A	E	S	L	T	V	E	Q	R	L	E	L	L	E	K	A	L	R	E	T	Q	S	E	L	K	K	Y	K	D	E	E	K	K	K	Y	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	A	T	V	N	R	S	V	S	T	N	D	Q	G	Y	A	A	N	P	F	P	T	S	S	A	A	K	P	D	A	V	L	V	K	N	E	E	K	N	A	S	E	T	G	S	I	Y	S	S	M	T	L	K	D	F	S	K	F	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	E	I	G	F	S	Y	N	G	Y	Y	R	S	G	W	G	T	A	S	H	G	S	P	K	S	W	A	I	G	S	L	G	R	F	G	N	E	Y	S	G	W	F	D	L	Q	L	K	Q	R	V	Y	N	E	N	G	K	R	V	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	V	M	M	D	G	N	V	G	Q	Q	Y	S	T	G	W	F	G	D	N	A	G	G	E	N	Y	M	Q	F	S	D	M	Y	V	T	T	K	G	F	L	P	F	A	P	E	A	D	F	W	V	G	K	H	G	A	P	K	I	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	M	L	D	W	K	T	Q	R	T	D	A	A	A	G	V	G	L	E	N	W	K	V	G	P	G	K	I	D	I	A	L	V	R	E	D	V	D	D	Y	D	R	S	L	Q	N	K	Q	Q	I	N	T	N	T	I	D	L	R	Y	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	I	P	L	W	D	K	A	T	L	M	V	S	G	R	Y	V	T	A	N	E	S	A	S	E	K	D	N	Q	D	N	N	G	Y	Y	D	W	K	D	T	W	M	F	G	T	S	L	T	Q	K	F	D	K	G	G	F	N	E	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	L	V	A	N	N	S	I	A	S	N	F	G	R	Y	A	G	A	S	P	F	T	T	F	N	G	R	Y	Y	G	D	H	T	G	G	T	A	V	R	L	T	S	Q	G	E	A	Y	I	G	D	H	F	I	V	A	N	A	I	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	F	G	N	D	I	Y	S	Y	E	T	G	A	H	S	D	F	E	S	I	R	A	V	V	R	P	A	Y	I	W	D	Q	Y	N	Q	T	G	V	E	L	G	Y	F	T	Q	Q	N	K	D	A	N	S	N	K	F	N	E	S	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?	?	?	?	?	?	?																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		K	T	T	L	F	H	T	F	K	V	N	T	S	M	L	T	S	R	P	E	I	R	F	Y	A	T	Y	I	K	A	L	E	N	E	L	D	G	F	T	F	E	D	N	K	D	D	Q	F	A	V	G	A	Q	A	E	I	W	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand