Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77529 Date Thu Jan 5 12:30:19 GMT 2012 Unique Job ID bcc5489b2ca5c18a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	F	P	L	I	A	N	I	V	V	F	V	V	L	L	F	A	L	A	Q	T	R	H	K	Q	W	S	L	A	K	K	V	L	V	G	L	V	M	G	V	V	F	G	L	A	L	H	T	I	Y	G	S	D	S	Q	V	L	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																			?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	V	Q	W	F	N	I	V	G	N	G	Y	V	Q	L	L	Q	M	I	V	M	P	L	V	F	A	S	I	L	S	A	V	A	R	L	H	N	A	S	Q	L	G	K	I	S	F	L	T	I	G	T	L	L	F	T	T	L	I	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	V	G	V	L	V	T	N	L	F	G	L	T	A	E	G	L	V	Q	G	G	A	E	T	A	R	L	N	A	I	E	S	N	Y	V	G	K	V	S	D	L	S	V	P	Q	L	V	L	S	F	I	P	K	N	P	F	A	D	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	A	N	P	T	S	I	I	S	V	V	I	F	A	A	F	L	G	V	A	A	L	K	L	L	K	D	D	A	P	K	G	E	R	V	L	A	A	I	D	T	L	Q	S	W	V	M	K	L	V	R	L	V	M	Q	L	T	P	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	L	A	L	M	T	K	V	V	A	G	S	N	L	Q	D	I	I	K	L	G	S	F	V	V	A	S	Y	L	G	L	L	I	M	F	A	V	H	G	I	L	L	G	I	N	G	V	S	P	L	K	Y	F	R	K	V	W	P	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	F	A	F	T	S	R	S	S	A	A	S	I	P	L	N	V	E	A	Q	T	R	R	L	G	V	P	E	S	I	A	S	F	A	A	S	F	G	A	T	I	G	Q	N	G	C	A	G	L	Y	P	A	M	L	A	V	M	V	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	V	G	I	N	P	L	D	P	M	W	I	A	T	L	V	G	I	V	T	V	S	S	A	G	V	A	G	V	G	G	G	A	T	F	A	A	L	I	V	L	P	A	M	G	L	P	V	T	L	V	A	L	L	I	S	V	E	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Sequence		I	D	M	G	R	T	A	L	N	V	S	G	S	M	T	A	G	T	L	T	S	Q	W	L	K	Q	T	D	K	A	I	L	D	S	E	D	D	A	E	L	A	H	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand