Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76578 Date Wed Jan 25 15:21:09 GMT 2012 Unique Job ID bcbb97527c014f13

Secondary structure and disorder prediction

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Sequence		M	K	K	L	R	V	A	A	C	M	L	M	L	A	L	A	G	C	D	N	N	D	N	A	P	T	A	V	K	K	D	A	P	S	E	V	T	K	A	A	S	S	E	N	A	S	S	A	K	L	S	V	P	E	R	Q	K	L	A	Q
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Secondary structure
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Disorder		?													?	?	?	?	?	?												?	?		?	?		?	?								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	K	E	L	R	L	R	H	L	E	P	K	R	D	L	I	V	T	I	G	K	E	V	K	A	L	N	N	A	T	F	S	K	D	Y	E	K	T	I	T	T	R	D	I	Q	P	S	V	G	F	A	S	R	G	S	L	L	P	G	K
Secondary structure
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Disorder																								?	?	?	?	?	?			?														?						?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	V	E	G	L	P	V	M	A	L	N	V	N	N	V	D	V	N	F	F	R	V	K	P	E	S	L	P	A	F	I	S	Q	W	E	Y	R	N	S	L	A	N	W	Q	S	D	K	L	L	Q	M	A	D	L	V	Y	T	G	R	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																															?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	L	N	P	A	R	N	T	R	E	K	L	L	L	P	L	G	D	I	K	P	L	Q	Q	A	G	V	Y	L	A	V	M	N	Q	A	G	R	Y	D	Y	S	N	P	A	T	L	F	T	L	S	D	I	G	V	S	A	H	R	Y	H
Secondary structure
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Disorder							?	?	?											?	?	?														?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
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Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?
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Sequence		T	T	L	L	D	L	K	L	P	A	L	D	L	A	E	F	N	I	A	G	A	P	G	Y	S	K	Q	F	F	M	F	G	P	R	D	L	Y	R	P	G	E	T	V	I	L	N	G	L	L	R	D	A	D	G	K	A	L	P	N	Q
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Disorder									?	?											?	?	?	?																															?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	I	K	L	D	V	I	K	P	D	G	Q	V	L	R	S	V	V	S	Q	P	E	N	G	L	Y	H	F	T	W	P	L	D	S	N	A	A	T	G	M	W	H	I	R	A	N	T	G	D	N	Q	Y	R	M	W	D	F	H	V	E
Secondary structure
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Disorder																																			?		?	?	?	?									?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	F	M	P	E	R	M	A	L	N	L	T	G	E	K	T	P	L	T	P	K	D	E	V	K	F	S	V	V	G	Y	Y	L	Y	G	A	P	A	N	G	N	T	L	Q	G	Q	L	F	L	R	P	L	R	E	A	V	S	A	L	P
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Disorder															?	?	?	?	?	?	?																																	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	F	E	F	G	D	I	A	A	E	N	L	S	R	T	L	D	E	V	Q	L	T	L	D	D	K	G	R	G	E	V	S	T	E	S	Q	W	K	E	T	H	S	P	L	Q	V	I	F	Q	G	S	L	L	E	S	G	G	R	P	V
Secondary structure
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Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?															?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		T	R	R	A	E	Q	A	I	W	P	A	D	A	L	P	G	I	R	P	Q	F	A	S	K	S	V	Y	D	Y	R	T	D	S	T	V	K	Q	P	I	V	D	E	G	S	N	A	A	F	D	I	V	Y	S	D	A	Q	G	V	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?											?								?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		A	V	S	G	L	Q	V	R	L	I	R	E	R	R	D	Y	Y	W	N	W	S	E	D	E	G	W	Q	S	Q	F	D	Q	K	D	L	I	E	N	E	Q	T	L	D	L	K	A	D	E	T	G	K	V	S	F	P	V	E	W	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?										?							?	?	?	?	?						?	?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		Y	R	L	E	V	K	A	P	N	E	A	V	S	S	V	R	F	W	A	G	Y	S	W	Q	D	N	S	D	G	S	G	A	V	R	P	D	R	V	T	L	K	L	D	K	A	S	Y	R	P	G	D	T	I	K	L	H	I	A	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		T	A	G	K	G	Y	A	M	V	E	S	S	E	G	P	L	W	W	Q	E	I	D	V	R	A	Q	G	L	D	L	T	I	P	V	D	K	T	W	N	R	H	D	L	Y	L	S	T	L	V	V	R	P	G	D	K	S	R	S	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		P	K	R	A	V	G	V	L	H	L	P	L	G	D	E	N	R	R	L	D	L	A	L	E	T	P	A	K	M	R	P	N	Q	P	L	T	V	K	I	K	A	S	T	K	N	G	E	K	P	K	Q	V	N	V	L	V	S	A	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																								?	?															?		?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
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Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?									?	?	?	?		?		?																											?				?	?		?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		V	I	A	E	L	N	M	P	R	F	M	A	S	G	D	T	S	R	L	T	L	D	I	T	N	L	T	D	K	P	Q	K	L	N	V	A	L	T	A	S	G	L	L	E	L	V	S	D	S	P	A	A	V	E	L	A	P	G	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
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Disorder											?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?										?		?
Disorder confidence
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Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?					?			?		?															?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		T	N	A	A	Q	L	Q	A	L	G	I	K	G	D	S	D	E	K	R	R	A	S	V	D	I	G	I	S	R	L	L	Q	M	Q	R	D	N	G	G	F	A	L	W	D	K	N	G	D	E	E	Y	W	L	T	A	Y	V	M	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?			?
Disorder confidence
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Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		K	A	P	L	G	A	L	R	E	I	W	E	H	R	A	D	A	A	S	G	L	P	L	L	Q	L	G	V	A	L	K	T	M	G	D	A	T	R	G	E	E	A	I	A	L	A	L	K	T	P	R	N	S	D	E	R	I	W	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?													?	?	?	?																?	?													?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		D	Y	G	S	S	L	R	D	N	A	L	M	L	S	L	L	E	E	N	K	L	L	P	D	E	Q	Y	T	L	L	N	T	L	S	Q	Q	A	F	G	E	R	W	L	S	T	Q	E	S	N	A	L	F	L	A	A	R	T	I	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?																	?
Disorder confidence
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Sequence		L	P	G	K	W	Q	A	Q	T	S	F	S	A	E	Q	L	T	G	E	K	A	Q	N	S	N	L	N	S	D	Q	L	V	T	L	Q	V	S	N	S	G	D	Q	P	L	W	L	R	M	D	A	S	G	Y	P	Q	S	A	P	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		A	N	N	V	L	Q	I	E	R	H	I	L	G	T	D	G	K	S	K	S	L	D	S	L	R	S	G	D	L	V	L	V	W	L	Q	V	K	A	S	N	S	V	P	D	A	L	V	V	D	L	L	P	A	G	L	E	L	E	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																	?	?	?	?	?	?																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620
Sequence		N	L	A	N	G	S	A	S	L	E	Q	S	G	G	E	V	Q	N	L	L	N	Q	M	Q	Q	A	S	I	K	H	I	E	F	R	D	D	R	F	V	A	A	V	A	V	D	E	Y	Q	P	V	T	L	V	Y	L	A	R	A	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.
Sequence		P	G	T	Y	Q	V	P	Q	P	M	V	E	S	M	Y	V	P	Q	W	R	A	T	G	A	A	E	D	L	L	I	V	R	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?		?	?	?					?	?	?
Disorder confidence