Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFA7 Date Thu Jan 5 11:25:45 GMT 2012 Unique Job ID bc772c7cb77d723d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	I	S	W	G	R	A	L	W	R	N	F	L	G	Q	S	P	D	W	Y	K	L	A	L	I	I	F	L	I	V	N	P	L	I	F	L	I	S	P	F	V	A	G	W	L	L	V	A	E	F	I	F	T	L	A	M	A	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		C	Y	P	L	L	P	G	G	L	L	A	I	E	A	V	F	I	G	M	T	S	A	E	H	V	R	E	E	V	A	A	N	L	E	V	L	L	L	L	M	F	M	V	A	G	I	Y	F	M	K	Q	L	L	L	F	I	F	T	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	S	I	R	S	K	M	L	L	S	L	S	F	C	V	A	A	A	F	L	S	A	F	L	D	A	L	T	V	V	A	V	V	I	S	V	A	V	G	F	Y	G	I	Y	H	R	V	A	S	S	R	T	E	D	T	D	L	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	S	H	I	D	K	H	Y	K	V	V	L	E	Q	F	R	G	F	L	R	S	L	M	M	H	A	G	V	G	T	A	L	G	G	V	M	T	M	V	G	E	P	Q	N	L	I	I	A	K	A	A	G	W	H	F	G	D	F	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?																?			?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	M	S	P	V	T	V	P	V	L	I	C	G	L	L	T	C	L	L	V	E	K	L	R	W	F	G	Y	G	E	T	L	P	E	K	V	R	E	V	L	Q	Q	F	D	D	Q	S	R	H	Q	R	T	R	Q	D	K	I	R	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	Q	A	I	I	G	V	W	L	V	T	A	L	A	L	H	L	A	E	V	G	L	I	G	L	S	V	I	I	L	A	T	S	L	T	G	V	T	D	E	H	A	I	G	K	A	F	T	E	S	L	P	F	T	A	L	L	T	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	S	V	V	A	V	I	I	D	Q	Q	L	F	S	P	I	I	Q	F	V	L	Q	A	S	E	H	A	Q	L	S	L	F	Y	I	F	N	G	L	L	S	S	I	S	D	N	V	F	V	G	T	I	Y	I	N	E	A	K	A	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	S	G	A	I	T	L	K	Q	Y	E	L	L	A	V	A	I	N	T	G	T	N	L	P	S	V	A	T	P	N	G	Q	A	A	F	L	F	L	L	T	S	A	L	A	P	L	I	R	L	S	Y	G	R	M	V	W	M	A	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?													?			?																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Sequence		Y	T	L	V	L	T	L	V	G	L	L	C	V	E	F	T	L	A	P	V	T	E	W	F	M	Q	M	G	W	I	A	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand