Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77522 Date Thu Jan 5 12:30:15 GMT 2012 Unique Job ID bbefcf8d874204b8

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	R	N	T	E	A	T	D	D	V	K	T	W	T	G	G	P	L	N	Y	K	E	G	F	F	T	Q	L	A	T	D	E	L	A	K	G	I	N	E	E	V	V	R	A	I	S	A	K	R	N	E	P	E	W	M	L	E	F	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?							?																			?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	N	A	Y	R	A	W	L	E	M	E	E	P	H	W	L	K	A	H	Y	D	K	L	N	Y	Q	D	Y	S	Y	Y	S	A	P	S	C	G	N	C	D	D	T	C	A	S	E	P	G	A	V	Q	Q	T	G	A	N	A	F	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	E	V	E	A	A	F	E	Q	L	G	V	P	V	R	E	G	K	E	V	A	V	D	A	I	F	D	S	V	S	V	A	T	T	Y	R	E	K	L	A	E	Q	G	I	I	F	C	S	F	G	E	A	I	H	D	H	P	E	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	K	Y	L	G	T	V	V	P	G	N	D	N	F	F	A	A	L	N	A	A	V	A	S	D	G	T	F	I	Y	V	P	K	G	V	R	C	P	M	E	L	S	T	Y	F	R	I	N	A	E	K	T	G	Q	F	E	R	T	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	A	D	E	D	S	Y	V	S	Y	I	E	G	C	S	A	P	V	R	D	S	Y	Q	L	H	A	A	V	V	E	V	I	I	H	K	N	A	E	V	K	Y	S	T	V	Q	N	W	F	P	G	D	N	N	T	G	G	I	L	N	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	T	K	R	A	L	C	E	G	E	N	S	K	M	S	W	T	Q	S	E	T	G	S	A	I	T	W	K	Y	P	S	C	I	L	R	G	D	N	S	I	G	E	F	Y	S	V	A	L	T	S	G	H	Q	Q	A	D	T	G	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	I	H	I	G	K	N	T	K	S	T	I	I	S	K	G	I	S	A	G	H	S	Q	N	S	Y	R	G	L	V	K	I	M	P	T	A	T	N	A	R	N	F	T	Q	C	D	S	M	L	I	G	A	N	C	G	A	H	T	F	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?				?								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	V	E	C	R	N	N	S	A	Q	L	E	H	E	A	T	T	S	R	I	G	E	D	Q	L	F	Y	C	L	Q	R	G	I	S	E	E	D	A	I	S	M	I	V	N	G	F	C	K	D	V	F	S	E	L	P	L	E	F	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Sequence		E	A	Q	K	L	L	A	I	S	L	E	H	S	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand