Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76398 Date Thu Jan 5 12:22:39 GMT 2012 Unique Job ID bba10a0ebc260423

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	V	L	P	P	S	S	T	G	G	P	S	R	L	F	I	M	R	P	V	A	T	T	L	L	M	V	A	I	L	L	A	G	I	I	G	Y	R	A	L	P	V	S	A	L	P	E	V	D	Y	P	T	I	Q	V	V	T	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	G	A	S	P	D	V	M	T	S	A	V	T	A	P	L	E	R	Q	F	G	Q	M	S	G	L	K	Q	M	S	S	Q	S	S	G	G	A	S	V	I	T	L	Q	F	Q	L	T	L	P	L	D	V	A	E	Q	E	V	Q	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	N	A	A	T	N	L	L	P	S	D	L	P	N	P	P	V	Y	S	K	V	N	P	A	D	P	P	I	M	T	L	A	V	T	S	T	A	M	P	M	T	Q	V	E	D	M	V	E	T	R	V	A	Q	K	I	S	Q	I	S	G
Secondary structure
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Disorder								?	?	?	?		?	?			?			?	?	?		?	?		?										?		?	?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	G	L	V	T	L	S	G	G	Q	R	P	A	V	R	V	K	L	N	A	Q	A	I	A	A	L	G	L	T	S	E	T	V	R	T	A	I	T	G	A	N	V	N	S	A	K	G	S	L	D	G	P	S	R	A	V	T	L	S	A
Secondary structure
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Disorder		?					?	?	?	?																	?														?	?	?	?	?	?	?			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	D	Q	M	Q	S	A	E	E	Y	R	Q	L	I	I	A	Y	Q	N	G	A	P	I	R	L	G	D	V	A	T	V	E	Q	G	A	E	N	S	W	L	G	A	W	A	N	K	E	Q	A	I	V	M	N	V	Q	R	Q	P	G	A
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Disorder		?	?	?	?																																	?	?	?																		?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	I	I	S	T	A	D	S	I	R	Q	M	L	P	Q	L	T	E	S	L	P	K	S	V	K	V	T	V	L	S	D	R	T	T	N	I	R	A	S	V	D	D	T	Q	F	E	L	M	M	A	I	A	L	V	V	M	I	I	Y	L
Secondary structure
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Disorder		?																		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	L	R	N	I	P	A	T	I	I	P	G	V	A	V	P	L	S	L	I	G	T	F	A	V	M	V	F	L	D	F	S	I	N	N	L	T	L	M	A	L	T	I	A	T	G	F	V	V	D	D	A	I	V	V	I	E	N	I	S
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Disorder
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Sequence		R	Y	I	E	K	G	E	K	P	L	A	A	A	L	K	G	A	G	E	I	G	F	T	I	I	S	L	T	F	S	L	I	A	V	L	I	P	L	L	F	M	G	D	I	V	G	R	L	F	R	E	F	A	I	T	L	A	V	A	I
Secondary structure
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Disorder						?			?																																				?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	I	S	A	V	V	S	L	T	L	T	P	M	M	C	A	R	M	L	S	Q	E	S	L	R	K	Q	N	R	F	S	R	A	S	E	K	M	F	D	R	I	I	A	A	Y	G	R	G	L	A	K	V	L	N	H	P	W	L	T	L
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Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	V	A	L	S	T	L	L	L	S	V	L	L	W	V	F	I	P	K	G	F	F	P	V	Q	D	N	G	I	I	Q	G	T	L	Q	A	P	Q	S	S	S	F	A	N	M	A	Q	R	Q	R	Q	V	A	D	V	I	L	Q	D	P
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	V	Q	S	L	T	S	F	V	G	V	D	G	T	N	P	S	L	N	S	A	R	L	Q	I	N	L	K	P	L	D	E	R	D	D	R	V	Q	K	V	I	A	R	L	Q	T	A	V	D	K	V	P	G	V	D	L	F	L	Q	P
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		T	Q	D	L	T	I	D	T	Q	V	S	R	T	Q	Y	Q	F	T	L	Q	A	T	S	L	D	A	L	S	T	W	V	P	Q	L	M	E	K	L	Q	Q	L	P	Q	L	S	D	V	S	S	D	W	Q	D	K	G	L	V	A	Y	V
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		N	V	D	R	D	S	A	S	R	L	G	I	S	M	A	D	V	D	N	A	L	Y	N	A	F	G	Q	R	L	I	S	T	I	Y	T	Q	A	N	Q	Y	R	V	V	L	E	H	N	T	E	N	T	P	G	L	A	A	L	D	T	I
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		R	L	T	S	S	D	G	G	V	V	P	L	S	S	I	A	K	I	E	Q	R	F	A	P	L	S	I	N	H	L	D	Q	F	P	V	T	T	I	S	F	N	V	P	D	N	Y	S	L	G	D	A	V	Q	A	I	M	D	T	E	K
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		T	L	N	L	P	V	D	I	T	T	Q	F	Q	G	S	T	L	A	F	Q	S	A	L	G	S	T	V	W	L	I	V	A	A	V	V	A	M	Y	I	V	L	G	I	L	Y	E	S	F	I	H	P	I	T	I	L	S	T	L	P	T
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		A	G	V	G	A	L	L	A	L	L	I	A	G	S	E	L	D	V	I	A	I	I	G	I	I	L	L	I	G	I	V	K	K	N	A	I	M	M	I	D	F	A	L	A	A	E	R	E	Q	G	M	S	P	R	E	A	I	Y	Q	A
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		C	L	L	R	F	R	P	I	L	M	T	T	L	A	A	L	L	G	A	L	P	L	M	L	S	T	G	V	G	A	E	L	R	R	P	L	G	I	G	M	V	G	G	L	I	V	S	Q	V	L	T	L	F	T	T	P	V	I	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040
Sequence		L	F	D	R	L	A	L	W	T	K	S	R	F	A	R	H	E	E	E	A
Secondary structure
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Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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