Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37645 Date Thu Jan 5 11:56:17 GMT 2012 Unique Job ID bb386fcfaf3ee188

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	K	A	G	K	I	T	A	A	I	S	G	A	F	L	L	L	I	V	V	A	I	I	L	I	A	T	F	D	W	N	R	L	K	P	T	I	N	Q	K	V	S	A	E	L	N	R	P	F	A	I	R	G	D	L	G	V	V	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	R	Q	K	Q	E	T	G	W	R	S	W	V	P	W	P	H	V	H	A	E	D	I	I	L	G	N	P	P	D	I	P	E	V	T	M	V	H	L	P	R	V	E	A	T	L	A	P	L	A	L	L	T	K	T	V	W	L	P	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?		?																		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	K	L	E	K	P	D	A	R	L	I	R	L	S	E	K	N	N	N	W	T	F	N	L	A	N	D	D	N	K	D	A	N	A	K	P	S	A	W	S	F	R	L	D	N	I	L	F	D	Q	G	R	I	A	I	D	D	K	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?												?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	A	D	L	E	I	F	V	D	P	L	G	K	P	L	P	F	S	E	V	T	G	S	K	G	K	A	D	K	E	K	V	G	D	Y	V	F	G	L	K	A	Q	G	R	Y	N	G	E	P	L	T	G	T	G	K	I	G	G	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?										?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	L	R	G	E	G	T	P	F	P	V	Q	A	D	F	R	S	G	N	T	R	V	A	F	D	G	V	V	N	D	P	M	K	M	G	G	V	D	L	R	L	K	F	S	G	D	S	L	G	D	L	Y	E	L	T	G	V	L	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?								?			?												?	?		?		?																			?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	T	P	P	F	E	T	D	G	R	L	V	A	K	I	D	T	E	K	S	S	V	F	D	Y	R	G	F	N	G	R	I	G	D	S	D	I	H	G	S	L	V	Y	T	T	G	K	P	R	P	K	L	E	G	D	V	E	S	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?						?	?	?		?	?	?	?	?								?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	R	L	A	D	L	G	P	L	I	G	V	D	S	G	K	G	A	E	K	S	K	R	S	E	Q	K	K	G	E	K	S	V	Q	P	A	G	K	V	L	P	Y	D	R	F	E	T	D	K	W	D	V	M	D	A	D	V	R	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	R	R	I	E	H	G	S	S	L	P	I	S	D	L	S	T	H	I	I	L	K	N	A	D	L	R	L	Q	P	L	K	F	G	M	A	G	G	S	I	A	A	N	I	H	L	E	G	D	K	K	P	M	Q	G	R	A	D	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?																								?	?		?													?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	R	R	L	K	L	K	E	L	M	P	D	V	E	L	M	Q	K	T	L	G	E	M	N	G	D	A	E	L	R	G	S	G	N	S	V	A	A	L	L	G	N	S	N	G	N	L	K	L	L	M	N	D	G	L	V	S	R	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?																																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		M	E	I	V	G	L	N	V	G	N	Y	I	V	G	A	I	F	G	D	D	E	V	R	V	N	C	A	A	A	N	L	N	I	A	N	G	V	A	R	P	Q	I	F	A	F	D	T	E	N	A	L	I	N	V	T	G	T	A	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?																?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	S	E	Q	L	D	L	T	I	D	P	E	S	K	G	I	R	I	I	T	L	R	S	P	L	Y	V	R	G	T	F	K	N	P	Q	A	G	V	K	A	G	P	L	I	A	R	G	A	V	A	A	A	L	A	T	L	V	T	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?					?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	A	L	L	A	L	I	S	P	S	E	G	E	A	N	Q	C	R	T	I	L	S	Q	M	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand