Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P38134 Date Thu Jan 5 11:58:01 GMT 2012 Unique Job ID b8e9187e1d1e951f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	T	K	N	M	N	T	P	P	G	S	T	Q	E	N	E	I	D	L	L	R	L	V	G	E	L	W	D	H	R	K	F	I	I	S	V	T	A	L	F	T	L	I	A	V	A	Y	S	L	L	S	T	P	I	Y	Q	A	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	V	Q	V	E	Q	K	Q	G	N	A	I	L	S	G	L	S	D	M	I	P	N	S	S	P	E	S	A	P	E	I	Q	L	L	Q	S	R	M	I	L	G	K	T	I	A	E	L	N	L	R	D	I	V	E	Q	K	Y	F	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?																					?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	G	R	G	W	A	R	L	T	K	E	K	P	G	E	L	A	I	S	W	M	H	I	P	Q	L	N	G	Q	D	Q	Q	L	T	L	T	V	G	E	N	G	H	Y	T	L	E	G	E	E	F	T	V	N	G	M	V	G	Q	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?					?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?					?		?					?
Disorder confidence
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Sequence		E	K	D	G	V	A	L	T	I	A	D	I	K	A	K	P	G	T	Q	F	V	L	S	Q	R	T	E	L	E	A	I	N	A	L	Q	E	T	F	T	V	S	E	R	S	K	E	S	G	M	L	E	L	T	M	T	G	D	D	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	I	T	R	I	L	N	S	I	A	N	N	Y	L	Q	Q	N	I	A	R	Q	A	A	Q	D	S	Q	S	L	E	F	L	Q	R	Q	L	P	E	V	R	S	E	L	D	Q	A	E	E	K	L	N	V	Y	R	Q	Q	R	D	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	L	N	L	E	A	K	A	V	L	E	Q	I	V	N	V	D	N	Q	L	N	E	L	T	F	R	E	A	E	I	S	Q	L	Y	K	K	D	H	P	T	Y	R	A	L	L	E	K	R	Q	T	L	E	Q	E	R	K	R	L	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?						?	?	?																						?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	V	S	A	M	P	S	T	Q	Q	E	V	L	R	L	S	R	D	V	E	A	G	R	A	V	Y	L	Q	L	L	N	R	Q	Q	E	L	S	I	S	K	S	S	A	I	G	N	V	R	I	I	D	P	A	V	T	Q	P	Q	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																																			?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	P	K	K	A	L	N	V	V	L	G	F	I	L	G	L	F	I	S	V	G	A	V	L	A	R	A	M	L	R	R	G	V	E	A	P	E	Q	L	E	E	H	G	I	S	V	Y	A	T	I	P	M	S	E	W	L	D	K	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																																			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	L	R	K	K	N	L	F	S	N	Q	Q	R	H	R	T	K	N	I	P	F	L	A	V	D	N	P	A	D	S	A	V	E	A	V	R	A	L	R	T	S	L	H	F	A	M	M	E	T	E	N	N	I	L	M	I	T	G	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?							?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	D	S	G	K	T	F	V	S	S	T	L	A	A	V	I	A	Q	S	D	Q	K	V	L	F	I	D	A	D	L	R	R	G	Y	S	H	N	L	F	T	V	S	N	E	H	G	L	S	E	Y	L	A	G	K	D	E	L	N	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		I	Q	H	F	G	K	G	G	F	D	V	I	T	R	G	Q	V	P	P	N	P	S	E	L	L	M	R	D	R	M	R	Q	L	L	E	W	A	N	D	H	Y	D	L	V	I	V	D	T	P	P	M	L	A	V	S	D	A	A	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?								?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		G	R	S	V	G	T	S	L	L	V	A	R	F	G	L	N	T	A	K	E	V	S	L	S	M	Q	R	L	E	Q	A	G	V	N	I	K	G	A	I	L	N	G	V	I	K	R	A	S	T	A	Y	S	Y	G	Y	N	Y	Y	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		S	Y	S	E	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand