Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P00895 Date Thu Jan 5 10:57:06 GMT 2012 Unique Job ID b8cd2ed5ce31f9be

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	T	Q	K	P	T	L	E	L	L	T	C	E	G	A	Y	R	D	N	P	T	A	L	F	H	Q	L	C	G	D	R	P	A	T	L	L	L	E	S	A	D	I	D	S	K	D	D	L	K	S	L	L	L	V	D	S	A	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?				?																												?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	T	A	L	G	D	T	V	T	I	Q	A	L	S	G	N	G	E	A	L	L	A	L	L	D	N	A	L	P	A	G	V	E	S	E	Q	S	P	N	C	R	V	L	R	F	P	P	V	S	P	L	L	D	E	D	A	R	L	C	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?													?		?				?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	S	V	F	D	A	F	R	L	L	Q	N	L	L	N	V	P	K	E	E	R	E	A	M	F	F	G	G	L	F	S	Y	D	L	V	A	G	F	E	D	L	P	Q	L	S	A	E	N	N	C	P	D	F	C	F	Y	L	A	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	M	V	I	D	H	Q	K	K	S	T	R	I	Q	A	S	L	F	A	P	N	E	E	E	K	Q	R	L	T	A	R	L	N	E	L	R	Q	Q	L	T	E	A	A	P	P	L	P	V	V	S	V	P	H	M	R	C	E	C	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	D	E	E	F	G	G	V	V	R	L	L	Q	K	A	I	R	A	G	E	I	F	Q	V	V	P	S	R	R	F	S	L	P	C	P	S	P	L	A	A	Y	Y	V	L	K	K	S	N	P	S	P	Y	M	F	F	M	Q	D	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	T	L	F	G	A	S	P	E	S	S	L	K	Y	D	A	T	S	R	Q	I	E	I	Y	P	I	A	G	T	R	P	R	G	R	R	A	D	G	S	L	D	R	D	L	D	S	R	I	E	L	E	M	R	T	D	H	K	E	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?																				?	?	?	?	?	?												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	H	L	M	L	V	D	L	A	R	N	D	L	A	R	I	C	T	P	G	S	R	Y	V	A	D	L	T	K	V	D	R	Y	S	Y	V	M	H	L	V	S	R	V	V	G	E	L	R	H	D	L	D	A	L	H	A	Y	R	A	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	N	M	G	T	L	S	G	A	P	K	V	R	A	M	Q	L	I	A	E	A	E	G	R	R	R	G	S	Y	G	G	A	V	G	Y	F	T	A	H	G	D	L	D	T	C	I	V	I	R	S	A	L	V	E	N	G	I	A	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Sequence		Q	A	G	A	G	V	V	L	D	S	V	P	Q	S	E	A	D	E	T	R	N	K	A	R	A	V	L	R	A	I	A	T	A	H	H	A	Q	E	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand