Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33136 Date Thu Jan 5 11:51:14 GMT 2012 Unique Job ID b8a8486feea4c4a1

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	K	M	R	W	L	S	A	A	V	M	L	T	L	Y	T	S	S	S	W	A	F	S	I	D	D	V	A	K	Q	A	Q	S	L	A	G	K	G	Y	E	T	P	K	S	N	L	P	S	V	F	R	D	M	K	Y	A	D	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?											?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	I	Q	F	N	H	D	K	A	Y	W	N	N	L	K	T	P	F	K	L	E	F	Y	H	Q	G	M	Y	F	D	T	P	V	K	I	N	E	V	T	A	T	A	V	K	R	I	K	Y	S	P	D	Y	F	T	F	G	D	V	Q	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?			?		?		?	?																																?		?					?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	K	D	T	V	K	D	L	G	F	A	G	F	K	V	L	Y	P	I	N	S	K	D	K	N	D	E	I	V	S	M	L	G	A	S	Y	F	R	V	I	G	A	G	Q	V	Y	G	L	S	A	R	G	L	A	I	D	T	A	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																						?	?												?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	G	E	E	F	P	R	F	K	E	F	W	I	E	R	P	K	P	T	D	K	R	L	T	I	Y	A	L	L	D	S	P	R	A	T	G	A	Y	K	F	V	V	M	P	G	R	D	T	V	V	D	V	Q	S	K	I	Y	L	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	V	G	K	L	G	V	A	P	L	T	S	M	F	L	F	G	P	N	Q	P	S	P	A	N	N	Y	R	P	E	L	H	D	S	N	G	L	S	I	H	A	G	N	G	E	W	I	W	R	P	L	N	N	P	K	H	L	A	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?	?	?	?	?																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	F	S	M	E	N	P	Q	G	F	G	L	L	Q	R	G	R	D	F	S	R	F	E	D	L	D	D	R	Y	D	L	R	P	S	A	W	V	T	P	K	G	E	W	G	K	G	S	V	E	L	V	E	I	P	T	N	D	E	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	N	I	V	A	Y	W	T	P	D	Q	L	P	E	P	G	K	E	M	N	F	K	Y	T	I	T	F	S	R	D	E	D	K	L	H	A	P	D	N	A	W	V	Q	Q	T	R	R	S	T	G	D	V	K	Q	S	N	L	I	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?															?	?	?	?	?		?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	D	G	T	I	A	F	V	V	D	F	T	G	A	E	M	K	K	L	P	E	D	T	P	V	T	A	Q	T	S	I	G	D	N	G	E	I	V	E	S	T	V	R	Y	N	P	V	T	K	G	W	R	L	V	M	R	V	K	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?															?	?	?	?	?	?	?										?	?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Sequence		D	A	K	K	T	T	E	M	R	A	A	L	V	N	A	D	Q	T	L	S	E	T	W	S	Y	Q	L	P	A	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand