Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77510 Date Thu Jan 5 12:30:10 GMT 2012 Unique Job ID b7bb9b09f3c5308c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	Q	L	N	E	N	K	Q	F	A	F	F	Q	R	L	A	F	P	L	R	I	F	L	L	I	L	V	F	S	I	F	V	I	A	A	L	A	Q	Y	F	T	A	S	F	E	D	Y	L	T	L	H	V	R	D	M	A	M	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	K	I	I	A	S	N	D	S	V	I	S	A	V	K	T	R	D	Y	K	R	L	A	T	I	A	N	K	L	Q	R	D	T	D	F	D	Y	V	V	I	G	D	R	H	S	I	R	L	Y	H	P	N	P	E	K	I	G	Y	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?								?	?	?	?																																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	F	T	K	Q	G	A	L	E	K	G	E	S	Y	F	I	T	G	K	G	S	M	G	M	A	M	R	A	K	T	P	I	F	D	D	D	G	K	V	I	G	V	V	S	I	G	Y	L	V	S	K	I	D	S	W	R	A	E	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?																																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	P	M	A	G	V	F	V	V	L	L	G	I	L	M	L	L	S	W	F	L	A	A	H	I	R	R	Q	M	M	G	M	E	P	K	Q	I	A	R	V	V	R	Q	Q	E	A	L	F	S	S	V	Y	E	G	L	I	A	V	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	G	Y	I	T	A	I	N	R	N	A	R	K	M	L	G	L	S	S	P	G	R	Q	W	L	G	K	P	I	V	E	V	V	R	P	A	D	F	F	T	E	Q	I	D	E	K	R	Q	D	V	V	A	N	F	N	G	L	S	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	N	R	E	A	I	R	S	G	D	D	L	L	G	A	I	I	S	F	R	S	K	D	E	I	S	T	L	N	A	Q	L	T	Q	I	K	Q	Y	V	E	S	L	R	T	L	R	H	E	H	L	N	W	M	S	T	L	N	G	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	M	K	E	Y	D	R	V	L	A	M	V	Q	G	E	S	Q	A	Q	Q	Q	L	I	D	S	L	R	E	A	F	A	D	R	Q	V	A	G	L	L	F	G	K	V	Q	R	A	R	E	L	G	L	K	M	I	I	V	P	G	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	S	Q	L	P	P	G	L	D	S	T	E	F	A	A	I	V	G	N	L	L	D	N	A	F	E	A	S	L	R	S	D	E	G	N	K	I	V	E	L	F	L	S	D	E	G	D	D	V	V	I	E	V	A	D	Q	G	C	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		P	E	S	L	R	D	K	I	F	E	Q	G	V	S	T	R	A	D	E	P	G	E	H	G	I	G	L	Y	L	I	A	S	Y	V	T	R	C	G	G	V	I	T	L	E	D	N	D	P	C	G	T	L	F	S	I	Y	I	P	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Sequence		K	P	N	D	S	S	I	N	P	I	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand