Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A932 Date Thu Jan 5 11:09:16 GMT 2012 Unique Job ID b7567e15f48db4e4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	K	N	I	F	K	F	S	V	L	T	L	A	V	L	S	L	T	A	C	T	L	V	P	G	Q	N	L	S	T	S	N	K	D	V	I	E	L	P	D	N	Q	Y	D	L	D	K	M	V	N	I	Y	P	V	T	P	G	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	Q	L	R	A	K	P	I	M	S	Q	A	N	P	E	L	E	Q	Q	I	A	N	Y	E	Y	R	I	G	I	G	D	V	L	M	V	T	V	W	D	H	P	E	L	T	T	P	A	G	Q	Y	R	S	A	S	D	T	G	N	W	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	A	D	G	A	I	F	Y	P	Y	I	G	R	L	K	V	A	G	K	T	L	T	Q	V	R	N	E	I	T	A	R	L	D	S	V	I	E	S	P	Q	V	D	V	S	V	A	A	F	R	S	Q	K	A	Y	V	T	G	E	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?																															?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	S	G	Q	Q	P	I	T	N	I	P	L	T	I	M	D	A	I	N	A	A	G	G	L	T	A	D	A	D	W	R	N	V	V	L	T	Q	N	G	V	K	T	K	V	N	L	Y	A	L	M	Q	R	G	D	L	R	Q	N	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?												?		?																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	H	P	G	D	I	L	F	I	P	R	N	D	D	L	K	V	F	V	M	G	E	V	G	K	Q	S	T	L	K	M	D	R	S	G	M	T	L	A	E	A	L	G	N	A	E	G	M	N	Q	D	V	A	D	A	T	G	I	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?													?					?	?	?														?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	R	A	T	Q	N	K	Q	N	G	K	I	A	N	I	Y	Q	L	N	A	K	D	A	S	A	M	I	L	G	T	E	F	Q	L	E	P	Y	D	I	V	Y	V	T	T	A	P	L	A	R	W	N	R	V	I	S	L	L	V	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	S	G	V	H	D	L	T	E	T	S	R	W	I	Q	T	W	P	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand