Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45428 Date Wed Jan 25 15:20:54 GMT 2012 Unique Job ID b6846ca38adce292

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	G	I	I	I	S	V	I	V	L	I	T	M	G	Y	L	I	L	K	N	Y	K	P	Q	V	V	L	A	A	A	G	I	F	L	M	M	C	G	V	W	L	G	F	G	G	V	L	D	P	T	K	S	S	G	Y	L	I	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	Y	N	E	I	L	R	M	L	S	N	R	I	A	G	L	G	L	S	I	M	A	V	G	G	Y	A	R	Y	M	E	R	I	G	A	S	R	A	M	V	S	L	L	S	R	P	L	K	L	I	R	S	P	Y	I	I	L	S	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?																																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	V	I	G	Q	I	M	A	Q	F	I	T	S	A	S	G	L	G	M	L	L	M	V	T	L	F	P	T	L	V	S	L	G	V	S	R	L	S	A	V	A	V	I	A	T	T	M	S	I	E	W	G	I	L	E	T	N	S	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?	?																			?	?	?	?														?			?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	A	Q	V	A	G	M	K	I	A	T	Y	F	F	H	Y	Q	L	P	V	A	S	C	V	I	I	S	V	A	I	S	H	F	F	V	Q	R	A	F	D	K	K	D	K	N	I	N	H	E	Q	A	E	Q	K	A	L	D	N	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	L	Y	Y	A	I	L	P	V	M	P	L	I	L	M	L	G	S	L	F	L	A	H	V	G	L	M	Q	S	E	L	H	L	V	V	V	M	L	L	S	L	T	V	T	M	F	V	E	F	F	R	K	H	N	L	R	E	T	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	V	Q	A	F	F	D	G	M	G	T	Q	F	A	N	V	V	T	L	V	V	A	G	E	I	F	A	K	G	L	T	T	I	G	T	V	D	A	V	I	R	G	A	E	H	S	G	L	G	G	I	G	V	M	I	I	M	A	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	A	I	C	A	I	V	M	G	S	G	N	A	P	F	M	S	F	A	S	L	I	P	N	I	A	A	G	L	H	V	P	A	V	V	M	I	M	P	M	H	F	A	T	T	L	A	R	A	V	S	P	I	T	A	V	V	V	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Sequence		S	G	I	A	G	V	S	P	F	A	V	V	K	R	T	A	I	P	M	A	V	G	F	V	V	N	M	I	A	T	I	T	L	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand