Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P22525 Date Thu Jan 5 11:38:56 GMT 2012 Unique Job ID b49ab12f3f68dcc3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	L	N	M	M	C	G	R	Q	L	S	A	I	S	L	C	L	A	V	T	F	A	P	L	F	N	A	Q	A	D	E	P	E	V	I	P	G	D	S	P	V	A	V	S	E	Q	G	E	A	L	P	Q	A	Q	A	T	A	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?				?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	G	I	Q	P	L	P	E	G	A	A	E	K	A	R	T	Q	I	E	S	Q	L	P	A	G	Y	K	P	V	Y	L	N	Q	L	Q	L	L	Y	A	A	R	D	M	Q	P	M	W	E	N	R	D	A	V	K	A	F	Q	Q	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	E	V	A	I	A	G	F	Q	P	Q	F	N	K	W	V	E	L	L	T	D	P	G	V	N	G	M	A	R	D	V	V	L	S	D	A	M	M	G	Y	L	H	F	I	A	N	I	P	V	K	G	T	R	W	L	Y	S	S	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?		?	?																						?						?	?	?		?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	A	L	A	T	P	P	L	S	V	I	N	Q	W	Q	L	A	L	D	K	G	Q	L	P	T	F	V	A	G	L	A	P	Q	H	P	Q	Y	A	A	M	H	E	S	L	L	A	L	L	C	D	T	K	P	W	P	Q	L	T	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?	?	?	?	?																								?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	T	L	R	P	G	Q	W	S	N	D	V	P	A	L	R	E	I	L	Q	R	T	G	M	L	D	G	G	P	K	I	T	L	P	G	D	D	T	P	T	D	A	V	V	S	P	S	A	V	T	V	E	T	A	E	T	K	P	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?									?												?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		K	Q	T	T	S	R	S	K	P	A	P	A	V	R	A	A	Y	D	N	E	L	V	E	A	V	K	R	F	Q	A	W	Q	G	L	G	A	D	G	A	I	G	P	A	T	R	D	W	L	N	V	T	P	A	Q	R	A	G	V	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	N	I	Q	R	L	R	L	L	P	T	E	L	S	T	G	I	M	V	N	I	P	A	Y	S	L	V	Y	Y	Q	N	G	N	Q	V	L	D	S	R	V	I	V	G	R	P	D	R	K	T	P	M	M	S	S	A	L	N	N	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?						?																																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	N	P	P	W	N	V	P	P	T	L	A	R	K	D	I	L	P	K	V	R	N	D	P	G	Y	L	E	S	H	G	Y	T	V	M	R	G	W	N	S	R	E	A	I	D	P	W	Q	V	D	W	S	T	I	T	A	S	N	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?															?	?	?				?					?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		F	R	F	Q	Q	A	P	G	P	R	N	S	L	G	R	Y	K	F	N	M	P	S	S	E	A	I	Y	L	H	D	T	P	N	H	N	L	F	K	R	D	T	R	A	L	S	S	G	C	V	R	V	N	K	A	S	D	L	A	N	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?						?																							?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	L	Q	D	A	G	W	N	D	K	R	I	S	D	A	L	K	Q	G	D	T	R	Y	V	N	I	R	Q	S	I	P	V	N	L	Y	Y	L	T	A	F	V	G	A	D	G	R	T	Q	Y	R	T	D	I	Y	N	Y	D	L	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Sequence		R	S	S	S	Q	I	V	S	K	A	E	Q	L	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?		?		?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand