Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33920 Date Thu Jan 5 11:52:46 GMT 2012 Unique Job ID b45d6039f491b205

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	L	D	I	N	Q	I	A	L	H	Q	L	I	K	R	D	E	Q	N	L	E	L	V	L	R	D	S	L	L	E	P	T	E	T	V	V	E	M	V	A	E	L	H	R	V	Y	S	A	K	N	K	A	Y	G	L	F	S	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?														?	?		?					?		?	?	?	?																		?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	E	L	A	Q	T	L	R	L	Q	R	Q	G	E	E	D	F	L	A	F	S	R	A	A	T	G	R	L	R	D	E	L	A	K	Y	P	F	A	D	G	G	F	V	L	F	C	H	Y	R	Y	L	A	V	E	Y	L	L	V	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	S	N	L	S	S	M	R	V	N	E	N	L	D	I	N	P	T	H	Y	L	D	I	N	H	A	D	I	V	A	R	I	D	L	T	E	W	E	T	N	P	E	S	T	R	Y	L	T	F	L	K	G	R	V	G	R	K	V	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?					?								?	?		?																?	?															?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	F	M	D	F	L	G	A	S	E	G	L	N	A	K	A	Q	N	R	G	L	L	Q	A	V	D	D	F	T	A	E	A	Q	L	D	K	A	E	R	Q	N	V	R	Q	Q	V	Y	S	Y	C	N	E	Q	L	Q	A	G	E	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?			?	?																				?	?																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	L	K	S	L	S	K	E	L	A	G	V	S	E	V	S	F	T	E	F	A	A	E	K	G	Y	E	L	E	E	S	F	P	A	D	R	S	T	L	R	Q	L	T	K	F	A	G	S	G	G	G	L	T	I	N	F	D	A	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?									?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Sequence		L	G	E	R	I	F	W	D	P	A	T	D	T	L	T	I	K	G	T	P	P	N	L	R	D	Q	L	Q	R	R	T	S	G	G	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																														?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand