Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75942 Date Thu Jan 5 12:16:14 GMT 2012 Unique Job ID b37cde9703b78dc0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	S	D	S	K	L	L	A	S	A	A	W	D	A	Q	S	L	N	E	L	K	A	K	A	G	E	D	P	A	A	N	I	R	P	V	A	R	Q	V	E	G	M	F	V	Q	M	M	L	K	S	M	R	D	A	L	P	K	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	F	S	S	E	H	T	R	L	Y	T	S	M	Y	D	Q	Q	I	A	Q	Q	M	T	A	G	K	G	L	G	L	A	E	M	M	V	K	Q	M	T	P	E	Q	P	L	P	E	E	S	T	P	A	A	P	M	K	F	P	L	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	V	R	Y	Q	N	Q	A	L	S	Q	L	V	Q	K	A	V	P	R	N	Y	D	D	S	L	P	G	D	S	K	A	F	L	A	Q	L	S	L	P	A	Q	L	A	S	Q	Q	S	G	V	P	H	H	L	I	L	A	Q	A	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	S	G	W	G	Q	R	Q	I	R	R	E	N	G	E	P	S	Y	N	L	F	G	V	K	A	S	G	N	W	K	G	P	V	T	E	I	T	T	T	E	Y	E	N	G	E	A	K	K	V	K	A	K	F	R	V	Y	S	S	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	A	L	S	D	Y	V	G	L	L	T	R	N	P	R	Y	A	A	V	T	T	A	A	S	A	E	Q	G	A	Q	A	L	Q	D	A	G	Y	A	T	D	P	H	Y	A	R	K	L	T	N	M	I	Q	Q	M	K	S	I	S	D	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Sequence		V	S	K	T	Y	S	M	N	I	D	N	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand