Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q47013 Date Thu Jan 5 12:36:09 GMT 2012 Unique Job ID b31bfff916f3524d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	V	T	V	V	S	N	Y	C	Q	L	S	Q	T	Q	L	S	Q	T	F	A	E	K	F	T	V	T	E	E	L	L	Q	S	L	K	K	T	A	L	S	G	D	E	E	S	I	E	L	L	H	N	I	A	L	G	Y	D	K	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																		?		?											?	?	?	?	?	?															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	K	E	A	E	D	I	L	Y	H	I	V	R	T	P	T	N	E	T	L	S	I	I	R	L	I	K	N	A	C	L	K	L	Y	N	L	A	H	I	A	T	N	S	P	L	K	S	H	D	S	D	D	L	L	F	K	K	L	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?		?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	S	K	L	M	T	I	I	G	D	E	I	P	L	I	S	E	K	Q	S	L	S	K	V	L	L	N	D	E	N	N	E	L	S	D	G	T	N	F	W	D	K	N	R	Q	L	T	T	D	E	I	A	C	Y	L	Q	K	I	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	A	K	N	T	Q	V	N	Y	P	T	G	L	Y	V	P	Y	S	T	R	T	H	L	E	D	A	L	N	E	N	I	K	S	D	P	S	W	P	N	E	V	Q	L	F	P	I	N	T	G	G	H	W	I	L	V	S	L	Q	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	N	K	K	N	N	K	L	Q	I	K	C	V	I	F	N	S	L	R	A	L	G	Y	D	K	E	N	S	L	K	R	V	I	N	S	F	N	S	E	L	M	G	E	M	S	N	N	N	I	K	V	H	L	N	E	P	E	I	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?																?	?	?	?										?	?								?	?	?		?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	H	A	D	L	Q	Q	Y	L	S	Q	S	C	G	A	F	V	C	M	A	A	Q	E	V	I	E	Q	R	E	S	N	S	D	S	A	P	Y	T	L	L	K	N	H	A	D	R	F	K	K	Y	S	A	E	E	Q	Y	E	I	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Sequence		Q	H	R	L	A	N	R	N	C	Y	L	D	K	Y	G	D	A	N	I	N	H	Y	Y	R	N	L	E	I	K	H	S	Q	P	K	N	R	A	S	G	K	R	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand