Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AE82 Date Thu Jan 5 11:22:45 GMT 2012 Unique Job ID ae4afd46928ec48a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	G	S	L	T	A	R	I	F	A	I	F	W	L	T	L	A	L	V	L	M	L	V	L	M	L	P	K	L	D	S	R	Q	M	T	E	L	L	D	S	E	Q	R	Q	G	L	M	I	E	Q	H	V	E	A	E	L	A	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	P	N	D	L	M	W	W	R	R	L	F	R	A	I	D	K	W	A	P	P	G	Q	R	L	L	L	V	T	T	E	G	R	V	I	G	A	E	R	S	E	M	Q	I	I	R	N	F	I	G	Q	A	D	N	A	D	H	P	Q	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?									?	?	?	?		?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	K	Y	G	R	V	E	L	V	G	P	F	S	V	R	D	G	E	D	N	Y	Q	L	Y	L	I	R	P	A	S	S	S	Q	S	D	F	I	N	L	L	F	D	R	P	L	L	L	L	I	V	T	M	L	V	S	T	P	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																											?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	L	A	W	S	L	A	K	P	A	R	K	L	K	N	A	A	D	E	V	A	Q	G	N	L	R	Q	H	P	E	L	E	A	G	P	Q	E	F	L	A	A	G	A	S	F	N	Q	M	V	T	A	L	E	R	M	M	T	S	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	L	L	S	D	I	S	H	E	L	R	T	P	L	T	R	L	Q	L	G	T	A	L	L	R	R	R	S	G	E	S	K	E	L	E	R	I	E	T	E	A	Q	R	L	D	S	M	I	N	D	L	L	V	M	S	R	N	Q	Q	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	A	L	V	S	E	T	I	K	A	N	Q	L	W	S	E	V	L	D	N	A	A	F	E	A	E	Q	M	G	K	S	L	T	V	N	F	P	P	G	P	W	P	L	Y	G	N	P	N	A	L	E	S	A	L	E	N	I	V	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	L	R	Y	S	H	T	K	I	E	V	G	F	A	V	D	K	D	G	I	T	I	T	V	D	D	D	G	P	G	V	S	P	E	D	R	E	Q	I	F	R	P	F	Y	R	T	D	E	A	R	D	R	E	S	G	G	T	G	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	A	I	V	E	T	A	I	Q	Q	H	R	G	W	V	K	A	E	D	S	P	L	G	G	L	R	L	V	I	W	L	P	L	Y	K	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand