Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ADY1 Date Thu Jan 5 11:22:05 GMT 2012 Unique Job ID ae0950031df61d5c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	M	D	S	L	R	T	A	A	N	S	L	V	L	K	I	I	F	G	I	I	I	V	S	F	I	L	T	G	V	S	G	Y	L	I	G	G	G	N	N	Y	A	A	K	V	N	D	Q	E	I	S	R	G	Q	F	E	N	A	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	E	R	N	R	M	Q	Q	Q	L	G	D	Q	Y	S	E	L	A	A	N	E	G	Y	M	K	T	L	R	Q	Q	V	L	N	R	L	I	D	E	A	L	L	D	Q	Y	A	R	E	L	K	L	G	I	S	D	E	Q	V	K	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	F	A	T	P	A	F	Q	V	D	G	K	F	D	N	S	R	Y	N	G	I	L	N	Q	M	G	M	T	A	D	Q	Y	A	Q	A	L	R	N	Q	L	T	T	Q	Q	L	I	N	G	V	A	G	T	D	F	M	L	K	G	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?	?		?	?		?	?												?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	E	L	A	A	L	V	A	Q	Q	R	V	V	R	E	A	T	I	D	V	N	A	L	A	A	K	Q	P	V	T	E	Q	E	I	A	S	Y	Y	E	Q	N	K	N	N	F	M	T	P	E	Q	F	R	V	S	Y	I	K	L	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	T	M	Q	Q	P	V	S	D	A	D	I	Q	S	Y	Y	D	Q	H	Q	D	Q	F	T	Q	P	Q	R	T	R	Y	S	I	I	Q	T	K	T	E	D	E	A	K	A	V	L	D	E	L	N	K	G	G	D	F	A	A	L	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?																								?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	K	S	A	D	I	I	S	A	R	N	G	G	D	M	G	W	L	E	D	A	T	I	P	D	E	L	K	N	A	G	L	K	E	K	G	Q	L	S	G	V	I	K	S	S	V	G	F	L	I	V	R	L	D	D	I	Q	P	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	K	S	L	D	E	V	R	D	D	I	A	A	K	V	K	H	E	K	A	L	D	A	Y	Y	A	L	Q	Q	K	V	S	D	A	A	S	N	D	T	E	S	L	A	G	A	E	Q	A	A	G	V	K	A	T	Q	T	G	W	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																	?	?	?	?	?	?	?							?	?				?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	D	N	L	P	E	E	L	N	F	K	P	V	A	D	A	I	F	N	G	G	L	V	G	E	N	G	A	P	G	I	N	S	D	I	I	T	V	D	G	D	R	A	F	V	L	R	I	S	E	H	K	P	E	A	V	K	P	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	V	Q	E	Q	V	K	A	L	V	Q	H	N	K	A	E	Q	Q	A	K	V	D	A	E	K	L	L	V	D	L	K	A	G	K	G	A	E	A	M	Q	A	A	G	L	K	F	G	E	P	K	T	L	S	R	S	G	R	D	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	Q	A	A	F	A	L	P	L	P	A	K	D	K	P	S	Y	G	M	A	T	D	M	Q	G	N	V	V	L	L	A	L	D	E	V	K	Q	G	S	M	P	E	D	Q	K	K	A	M	V	Q	G	I	T	Q	N	N	A	Q	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.
Sequence		F	E	A	L	M	S	N	L	R	K	E	A	K	I	K	I	G	D	A	L	E	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?		?		?				?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand