Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A830 Date Thu Jan 5 11:06:44 GMT 2012 Unique Job ID ad3481743787b5b3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	S	L	F	K	S	L	Y	F	Q	V	L	T	A	I	A	I	G	I	L	L	G	H	F	Y	P	E	I	G	E	Q	M	K	P	L	G	D	G	F	V	K	L	I	K	M	I	I	A	P	V	I	F	C	T	V	V	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	A	G	M	E	S	M	K	A	V	G	R	T	G	A	V	A	L	L	Y	F	E	I	V	S	T	I	A	L	I	I	G	L	I	I	V	N	V	V	Q	P	G	A	G	M	N	V	D	P	A	T	L	D	A	K	A	V	A	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	D	Q	A	K	D	Q	G	I	V	A	F	I	M	D	V	I	P	A	S	V	I	G	A	F	A	S	G	N	I	L	Q	V	L	L	F	A	V	L	F	G	F	A	L	H	R	L	G	S	K	G	Q	L	I	F	N	V	I	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?																				?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	S	Q	V	I	F	G	I	I	N	M	I	M	R	L	A	P	I	G	A	F	G	A	M	A	F	T	I	G	K	Y	G	V	G	T	L	V	Q	L	G	Q	L	I	I	C	F	Y	I	T	C	I	L	F	V	V	L	V	L	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	A	K	A	T	G	F	S	I	F	K	F	I	R	Y	I	R	E	E	L	L	I	V	L	G	T	S	S	S	E	S	A	L	P	R	M	L	D	K	M	E	K	L	G	C	R	K	S	V	V	G	L	V	I	P	T	G	Y	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	L	D	G	T	S	I	Y	L	T	M	A	A	V	F	I	A	Q	A	T	N	S	Q	M	D	I	V	H	Q	I	T	L	L	I	V	L	L	L	S	S	K	G	A	A	G	V	T	G	S	G	F	I	V	L	A	A	T	L	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	G	H	L	P	V	A	G	L	A	L	I	L	G	I	D	R	F	M	S	E	A	R	A	L	T	N	L	V	G	N	G	V	A	T	I	V	V	A	K	W	V	K	E	L	D	H	K	K	L	D	D	V	L	N	N	R	A	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?																																									?							?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	K	T	H	E	L	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand