Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76205 Date Thu Jan 5 12:20:31 GMT 2012 Unique Job ID aced4d7fdb55803c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	Q	N	D	I	I	I	R	T	H	Y	K	S	P	H	R	L	H	I	D	S	D	I	P	T	P	S	S	E	P	I	N	Q	F	A	R	Q	L	I	T	L	L	D	T	S	D	L	S	S	M	L	S	Y	C	V	T	Q	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	A	N	C	R	K	I	S	Q	N	C	Y	S	T	A	L	F	T	I	N	F	A	T	S	P	I	H	T	E	N	I	L	I	T	L	H	Y	K	K	E	I	I	S	L	L	L	E	T	T	P	I	K	A	N	H	L	R	S	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	Y	I	E	Q	E	Q	L	T	A	E	D	R	N	H	C	M	K	L	S	K	X	S	I	E	K	K	T	I	H	P	T	V	N	L	N	G	S	A	C	F	L	Q	S	P	S	D	A	I	F	C	R	H	L	S	L	Q	Y	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	S	L	R	N	G	K	G	K	V	N	L	I	K	H	Y	S	S	V	E	S	I	Q	Q	H	V	P	L	V	R	D	A	E	F	R	A	L	L	R	H	P	P	A	G	S	R	V	I	A	S	K	D	F	G	F	A	L	D	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	C	R	M	M	A	N	N	V	S	H	M	S	A	I	L	Y	I	D	N	H	T	L	S	V	R	L	R	I	K	Q	S	V	Y	G	Q	L	N	Y	V	V	S	V	Y	D	P	N	D	T	N	V	A	V	R	D	T	H	R	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?										?													?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	G	F	L	S	L	D	K	F	I	S	S	G	P	D	A	Q	T	W	A	D	R	Y	V	R	N	C	A	I	A	I	L	P	L	L	P	V	G	V	P	G	A	I	F	A	G	I	A	S	R	M	P	F	A	P	I	H	P	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?		?		?						?									?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	L	L	I	M	A	T	G	Q	S	Q	Q	L	I	T	L	F	K	Q	L	P	I	L	P	E	K	E	I	I	E	I	I	T	A	Q	N	S	V	G	T	P	A	L	F	L	A	M	M	N	G	H	T	D	N	V	K	I	F	M	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	I	Q	S	L	V	D	N	H	I	I	H	E	D	N	L	V	K	L	L	Q	T	K	S	A	N	E	T	P	G	L	Y	I	S	M	L	Y	G	F	D	E	I	I	D	I	F	L	N	A	L	T	T	P	I	A	Q	E	L	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?		?																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		K	K	L	V	M	S	I	L	A	M	K	I	H	D	G	E	P	G	L	Y	A	A	M	E	N	N	H	P	L	C	V	T	R	F	L	S	K	I	N	G	I	A	F	K	Y	K	L	S	K	A	N	I	M	D	L	L	K	G	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																											?	?	?	?	?	?		?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	Q	G	T	P	A	L	Y	I	A	M	S	K	G	N	E	D	V	V	L	S	Y	I	S	T	L	G	A	F	A	K	K	H	S	F	S	Q	H	Q	L	F	T	L	L	A	A	K	N	H	D	N	M	S	A	V	H	I	A	I	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
Sequence		H	K	H	Y	K	T	V	E	T	Y	Y	A	A	I	N	A	I	S	Q	S	L	S	F	S	A	D	E	I	K	T	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?		?	?	?	?	?	?									?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand