Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45537 Date Thu Jan 5 12:02:58 GMT 2012 Unique Job ID ace9cf229ab65d62

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	P	P	M	W	R	R	L	I	Y	H	P	D	I	N	Y	A	L	R	Q	T	L	V	L	C	L	P	V	A	V	G	L	M	L	G	E	L	R	F	G	L	L	F	S	L	V	P	A	C	C	N	I	A	G	L	D	T	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	R	F	F	K	R	L	I	I	G	A	S	L	F	A	T	C	S	L	L	T	Q	L	L	L	A	K	D	V	P	L	P	F	L	L	T	G	L	T	L	V	L	G	V	T	A	E	L	G	P	L	H	A	K	L	L	P	A	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	A	I	F	T	L	S	L	A	G	Y	M	P	V	W	E	P	L	L	I	Y	A	L	G	T	L	W	Y	G	L	F	N	W	F	W	F	W	I	W	R	E	Q	P	L	R	E	S	L	S	L	L	Y	R	E	L	A	D	Y	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?																								?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	A	K	Y	S	L	L	T	Q	H	T	D	P	E	K	A	L	P	P	L	L	V	R	Q	Q	K	A	V	D	L	I	T	Q	C	Y	Q	Q	M	H	M	L	S	A	Q	N	N	T	D	Y	K	R	M	L	R	I	F	Q	E	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?		?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	L	Q	E	H	I	S	V	S	L	H	Q	P	E	E	V	Q	K	L	V	E	R	S	H	A	E	E	V	I	R	W	N	A	Q	T	V	A	A	R	L	R	V	L	A	D	D	I	L	Y	H	R	L	P	T	R	F	T	M	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?		?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	I	G	A	L	E	K	I	A	R	Q	H	P	D	N	P	V	G	Q	F	C	Y	W	H	F	S	R	I	A	R	V	L	R	T	Q	K	P	L	Y	A	R	D	L	L	A	D	K	Q	R	R	M	P	L	L	P	A	L	K	S	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	S	L	K	S	P	A	L	R	N	A	G	R	L	S	V	M	L	S	V	A	S	L	M	G	T	A	L	H	L	P	K	S	Y	W	I	L	M	T	V	L	L	V	T	Q	N	G	Y	G	A	T	R	L	R	I	V	N	R	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	T	V	V	G	L	I	I	A	G	V	A	L	H	F	K	I	P	E	G	Y	T	L	T	L	M	L	I	T	T	L	A	S	Y	L	I	L	R	K	N	Y	G	W	A	T	V	G	F	T	I	T	A	V	Y	T	L	Q	L	L	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	N	G	E	Q	Y	I	L	P	R	L	I	D	T	I	I	G	C	L	I	A	F	G	G	T	V	W	L	W	P	Q	W	Q	S	G	L	L	R	K	N	A	H	D	A	L	E	A	Y	Q	E	A	I	R	L	I	L	S	E	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Q	P	T	P	L	A	W	Q	R	M	R	V	N	Q	A	H	N	T	L	Y	N	S	L	N	Q	A	M	Q	E	P	A	F	N	S	H	Y	L	A	D	M	K	L	W	V	T	H	S	Q	F	I	V	E	H	I	N	A	M	T	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	R	E	H	R	A	L	P	P	E	L	A	Q	E	Y	L	Q	S	C	E	I	A	I	Q	R	C	Q	Q	R	L	E	Y	D	E	P	G	S	S	G	D	A	N	I	M	D	A	P	E	M	Q	P	H	E	G	A	A	G	T	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		Q	H	L	Q	R	V	I	G	H	L	N	T	M	H	T	I	S	S	M	A	W	R	Q	R	P	H	H	G	I	W	L	S	R	K	L	R	D	S	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand