Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P18956 Date Thu Jan 5 11:37:12 GMT 2012 Unique Job ID acd5409637bd2c84

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	K	P	T	F	L	R	R	V	A	I	A	A	L	L	S	G	S	C	F	S	A	A	A	A	P	P	A	P	P	V	S	Y	G	V	E	E	D	V	F	H	P	V	R	A	K	Q	G	M	V	A	S	V	D	A	T	A	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	G	V	D	I	L	K	E	G	G	N	A	V	D	A	A	V	A	V	G	Y	A	L	A	V	T	H	P	Q	A	G	N	L	G	G	G	G	F	M	L	I	R	S	K	N	G	N	T	T	A	I	D	F	R	E	M	A	P	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	T	R	D	M	F	L	D	D	Q	G	N	P	D	S	K	K	S	L	T	S	H	L	A	S	G	T	P	G	T	V	A	G	F	S	L	A	L	D	K	Y	G	T	M	P	L	N	K	V	V	Q	P	A	F	K	L	A	R	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	I	V	N	D	A	L	A	D	D	L	K	T	Y	G	S	E	V	L	P	N	H	E	N	S	K	A	I	F	W	K	E	G	E	P	L	K	K	G	D	T	L	V	Q	A	N	L	A	K	S	L	E	M	I	A	E	N	G	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	F	Y	K	G	T	I	A	E	Q	I	A	Q	E	M	Q	K	N	G	G	L	I	T	K	E	D	L	A	A	Y	K	A	V	E	R	T	P	I	S	G	D	Y	R	G	Y	Q	V	Y	S	M	P	P	P	S	S	G	G	I	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	Q	I	L	N	I	L	E	N	F	D	M	K	K	Y	G	F	G	S	A	D	A	M	Q	I	M	A	E	A	E	K	Y	A	Y	A	D	R	S	E	Y	L	G	D	P	D	F	V	K	V	P	W	Q	A	L	T	N	K	A	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	S	I	A	D	Q	I	D	I	N	K	A	K	P	S	S	E	I	R	P	G	K	L	A	P	Y	E	S	N	Q	T	T	H	Y	S	V	V	D	K	D	G	N	A	V	A	V	T	Y	T	L	N	T	T	F	G	T	G	I	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?				?					?																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	E	S	G	I	L	L	N	N	Q	M	D	D	F	S	A	K	P	G	V	P	N	V	Y	G	L	V	G	G	D	A	N	A	V	G	P	N	K	R	P	L	S	S	M	S	P	T	I	V	V	K	D	G	K	T	W	L	V	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?		?		?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	P	G	G	S	R	I	I	T	T	V	L	Q	M	V	V	N	S	I	D	Y	G	L	N	V	A	E	A	T	N	A	P	R	F	H	H	Q	W	L	P	D	E	L	R	V	E	K	G	F	S	P	D	T	L	K	L	L	E	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Sequence		G	Q	K	V	A	L	K	E	A	M	G	S	T	Q	S	I	M	V	G	P	D	G	E	L	Y	G	A	S	D	P	R	S	V	D	D	L	T	A	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?																											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand