Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77272 Date Thu Jan 5 12:27:05 GMT 2012 Unique Job ID acb318e1dc78ed98

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	K	E	I	S	S	E	L	L	N	T	I	L	T	R	V	G	G	P	G	N	I	A	S	C	G	N	C	M	T	R	L	R	L	G	V	H	D	S	S	L	V	D	P	N	I	K	T	L	E	G	V	K	G	V	I	L	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	Q	V	Q	V	V	F	G	P	G	K	A	H	R	A	A	K	A	M	S	E	L	L	G	E	A	P	V	Q	D	A	A	E	I	A	A	Q	N	K	R	Q	L	K	A	K	Q	T	S	G	V	Q	Q	F	L	A	K	F	A	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	T	P	L	I	P	G	F	I	A	A	G	L	L	L	G	I	A	T	L	I	A	T	V	M	H	V	P	A	D	A	Q	G	T	L	P	D	A	L	N	F	M	K	V	F	S	K	G	L	F	T	F	L	V	I	L	V	G	Y	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?																		?		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	A	Q	A	F	G	G	T	G	V	N	G	A	I	I	A	A	L	F	L	L	G	Y	N	P	A	A	T	T	G	Y	Y	A	G	F	H	D	F	F	G	L	P	I	D	P	R	G	N	I	I	G	V	L	I	A	A	W	A	C	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?										?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	I	E	G	M	V	R	R	F	M	P	D	D	L	D	M	L	L	T	S	L	I	T	L	L	I	T	A	T	L	A	Y	L	I	I	M	P	L	G	G	W	L	F	E	G	M	S	W	L	F	M	H	L	N	S	N	P	F	G	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	V	L	A	G	L	F	L	I	A	V	V	F	G	V	H	Q	G	F	I	P	V	Y	L	A	L	M	D	S	Q	G	F	N	S	L	F	P	I	L	S	M	A	G	A	G	Q	V	G	A	A	L	A	L	Y	W	R	A	Q	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	A	L	R	S	Q	V	R	G	A	I	I	P	G	L	L	G	V	G	E	P	L	I	Y	G	V	T	L	P	R	M	K	P	F	V	T	A	C	L	G	G	A	A	G	G	L	F	I	G	L	I	A	W	W	G	L	P	M	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?																																																	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Sequence		N	S	A	F	G	P	S	G	L	V	A	L	P	L	M	T	S	A	Q	G	I	L	P	A	M	A	V	Y	A	G	G	I	L	V	A	W	V	C	G	F	I	F	T	T	L	F	G	C	R	N	V	N	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?											?																																?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand