Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P22259 Date Thu Jan 5 11:38:50 GMT 2012 Unique Job ID ac626557b65f9943

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	V	N	N	G	L	T	P	Q	E	L	E	A	Y	G	I	S	D	V	H	D	I	V	Y	N	P	S	Y	D	L	L	Y	Q	E	E	L	D	P	S	L	T	G	Y	E	R	G	V	L	T	N	L	G	A	V	A	V	D	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																				?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	F	T	G	R	S	P	K	D	K	Y	I	V	R	D	D	T	T	R	D	T	F	W	W	A	D	K	G	K	G	K	N	D	N	K	P	L	S	P	E	T	W	Q	H	L	K	G	L	V	T	R	Q	L	S	G	K	R	L	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																							?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	D	A	F	C	G	A	N	P	D	T	R	L	S	V	R	F	I	T	E	V	A	W	Q	A	H	F	V	K	N	M	F	I	R	P	S	D	E	E	L	A	G	F	K	P	D	F	I	V	M	N	G	A	K	C	T	N	P	Q	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	E	Q	G	L	N	S	E	N	F	V	A	F	N	L	T	E	R	M	Q	L	I	G	G	T	W	Y	G	G	E	M	K	K	G	M	F	S	M	M	N	Y	L	L	P	L	K	G	I	A	S	M	H	C	S	A	N	V	G	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?																																																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	D	V	A	V	F	F	G	L	S	G	T	G	K	T	T	L	S	T	D	P	K	R	R	L	I	G	D	D	E	H	G	W	D	D	D	G	V	F	N	F	E	G	G	C	Y	A	K	T	I	K	L	S	K	E	A	E	P	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	N	A	I	R	R	D	A	L	L	E	N	V	T	V	R	E	D	G	T	I	D	F	D	D	G	S	K	T	E	N	T	R	V	S	Y	P	I	Y	H	I	D	N	I	V	K	P	V	S	K	A	G	H	A	T	K	V	I	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	A	D	A	F	G	V	L	P	P	V	S	R	L	T	A	D	Q	T	Q	Y	H	F	L	S	G	F	T	A	K	L	A	G	T	E	R	G	I	T	E	P	T	P	T	F	S	A	C	F	G	A	A	F	L	S	L	H	P	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	A	E	V	L	V	K	R	M	Q	A	A	G	A	Q	A	Y	L	V	N	T	G	W	N	G	T	G	K	R	I	S	I	K	D	T	R	A	I	I	D	A	I	L	N	G	S	L	D	N	A	E	T	F	T	L	P	M	F	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	I	P	T	E	L	P	G	V	D	T	K	I	L	D	P	R	N	T	Y	A	S	P	E	Q	W	Q	E	K	A	E	T	L	A	K	L	F	I	D	N	F	D	K	Y	T	D	T	P	A	G	A	A	L	V	A	A	G	P	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?		?																																	?	?		?	?	?					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
Sequence
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand